More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4406 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  90.77 
 
 
457 aa  865    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1788  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  93.84 
 
 
470 aa  934    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4406  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
471 aa  988    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4787  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
471 aa  988    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.819616  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3695  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  68.61 
 
 
460 aa  661    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036835  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4493  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
471 aa  988    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.940392  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.49 
 
 
447 aa  320  5e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102143  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0324  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.46 
 
 
442 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6872  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.84 
 
 
452 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4719  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.6 
 
 
447 aa  220  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.11 
 
 
447 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.73 
 
 
449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.242613  normal  0.0404177 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0198  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.73 
 
 
449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0908  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.59 
 
 
441 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3715  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.7 
 
 
455 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2328  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.29 
 
 
456 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459675  normal  0.238108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3702  Rieske (2Fe-2S) region  27.48 
 
 
455 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.48 
 
 
455 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2271  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.16 
 
 
443 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  0.774548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.51 
 
 
469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3484  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.71 
 
 
469 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3723  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.89 
 
 
425 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3710  Rieske (2Fe-2S) region  38.89 
 
 
425 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3783  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.89 
 
 
425 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0573009  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3539  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.86 
 
 
448 aa  143  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.1 
 
 
430 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1988  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.78 
 
 
470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4357  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.61 
 
 
422 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3546  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.48 
 
 
476 aa  141  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.62 
 
 
423 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478644  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.12 
 
 
406 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.18 
 
 
409 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136632  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3683  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.91 
 
 
419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804885  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0966  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.44 
 
 
397 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0374518  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2464  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.6 
 
 
425 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31454  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.91 
 
 
362 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4184  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.56 
 
 
423 aa  136  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3536  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.14 
 
 
444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2976  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.62 
 
 
419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4213  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.06 
 
 
444 aa  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2260  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.45 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.58 
 
 
421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3730  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.15 
 
 
425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3717  Rieske (2Fe-2S) region  34.15 
 
 
425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.126427  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3790  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.15 
 
 
425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.144005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.55 
 
 
362 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.88 
 
 
423 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190649  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  30.49 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3376  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.62 
 
 
429 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151153  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3534  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
473 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3505  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.84 
 
 
449 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.62 
 
 
429 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.665588  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3747  Rieske (2Fe-2S) region  34.25 
 
 
440 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00627634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3820  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.25 
 
 
440 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365881  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.68 
 
 
384 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3276  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.9 
 
 
436 aa  123  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.02 
 
 
423 aa  123  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6914  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.9 
 
 
431 aa  123  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2261  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.34 
 
 
451 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3759  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.79 
 
 
440 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0223979  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  32.27 
 
 
414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0973  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.98 
 
 
396 aa  120  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0971663  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  32.08 
 
 
434 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  30.05 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2455  Rieske (2Fe-2S) protein  30.74 
 
 
388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2439  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.74 
 
 
449 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1007  putative Rieske-type ring dioxygenase  32.39 
 
 
387 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152396  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  30.18 
 
 
387 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  31.7 
 
 
380 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  28.96 
 
 
430 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0763  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.07 
 
 
360 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.68 
 
 
387 aa  107  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.83 
 
 
373 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  32.02 
 
 
445 aa  106  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0685  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.19 
 
 
484 aa  106  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  28.7 
 
 
432 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2476  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.65 
 
 
419 aa  106  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.75426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1622  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.19 
 
 
484 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0299575  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1595  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.19 
 
 
483 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0595  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.19 
 
 
483 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1647  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.19 
 
 
484 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.85 
 
 
430 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0463  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.76 
 
 
484 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.328369  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.4 
 
 
430 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.91 
 
 
432 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
419 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.85 
 
 
430 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6197  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  26.24 
 
 
429 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1861  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.8 
 
 
413 aa  104  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523473  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.93 
 
 
382 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  26.24 
 
 
429 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.84 
 
 
429 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.942727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.89 
 
 
427 aa  104  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  30.29 
 
 
373 aa  104  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2115  iron-sulphur Rieske protein  34.8 
 
 
413 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0835  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.8 
 
 
422 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4363  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.08 
 
 
487 aa  104  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000470921  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0747  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.8 
 
 
422 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.18 
 
 
430 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  27.97 
 
 
382 aa  103  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>