More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3484 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3484  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
469 aa  978    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3546  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.76 
 
 
476 aa  616  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.64 
 
 
449 aa  355  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.242613  normal  0.0404177 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0198  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.42 
 
 
449 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3534  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.45 
 
 
473 aa  330  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1988  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.06 
 
 
470 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0324  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.25 
 
 
442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2271  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.15 
 
 
443 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  0.774548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.02 
 
 
447 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102143  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6872  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.18 
 
 
452 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0908  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.9 
 
 
441 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3505  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.81 
 
 
449 aa  172  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4719  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.26 
 
 
447 aa  170  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.49 
 
 
447 aa  170  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2328  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.28 
 
 
456 aa  167  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459675  normal  0.238108 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3539  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.48 
 
 
448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2260  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.34 
 
 
448 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3695  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.73 
 
 
460 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3715  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.54 
 
 
455 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4787  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.71 
 
 
471 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.819616  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4406  Rieske (2Fe-2S) region  27.71 
 
 
471 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4493  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.71 
 
 
471 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.940392  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3702  Rieske (2Fe-2S) region  29.54 
 
 
455 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.54 
 
 
455 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.26 
 
 
469 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1788  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.15 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.23 
 
 
457 aa  148  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3536  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.6 
 
 
444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2261  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.92 
 
 
451 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.99 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  35.35 
 
 
380 aa  121  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0966  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.43 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0374518  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.51 
 
 
409 aa  119  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136632  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.72 
 
 
423 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.24 
 
 
398 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2976  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.86 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  31.82 
 
 
393 aa  114  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.41 
 
 
406 aa  114  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.28 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4071  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.3 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177236  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  27.14 
 
 
380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.86 
 
 
430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42190  aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  27.98 
 
 
448 aa  110  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0579776  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3376  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.13 
 
 
429 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151153  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.49 
 
 
423 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190649  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.09 
 
 
383 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1578  iron-sulphur Rieske protein  34.15 
 
 
437 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2671  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.83 
 
 
441 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  29.41 
 
 
393 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3710  Rieske (2Fe-2S) region  30.49 
 
 
425 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3723  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.49 
 
 
425 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.23 
 
 
432 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3783  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.49 
 
 
425 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0573009  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.28 
 
 
429 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.665588  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  32.63 
 
 
376 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5070  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.97 
 
 
437 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192805  hitchhiker  0.00646968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3717  Rieske (2Fe-2S) region  31.05 
 
 
425 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.126427  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3730  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.05 
 
 
425 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3790  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.05 
 
 
425 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.144005 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1007  putative Rieske-type ring dioxygenase  31.89 
 
 
387 aa  107  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152396  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.94 
 
 
376 aa  107  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3276  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.15 
 
 
436 aa  107  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.35 
 
 
382 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.48 
 
 
423 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478644  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.97 
 
 
426 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166676  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3840  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.68 
 
 
450 aa  106  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6914  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.15 
 
 
431 aa  106  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0890  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.6 
 
 
497 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145074  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4184  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.43 
 
 
423 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.81 
 
 
423 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1330  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
369 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2464  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29 
 
 
425 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31454  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.41 
 
 
362 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3747  Rieske (2Fe-2S) region  30.58 
 
 
440 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00627634  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.27 
 
 
413 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400487  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.5 
 
 
440 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000409814  normal  0.0305498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3820  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.58 
 
 
440 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365881  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.9 
 
 
362 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0578  Rieske (2Fe-2S) protein  34.3 
 
 
413 aa  104  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5015  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.27 
 
 
413 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277088  normal  0.658452 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3044  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.84 
 
 
369 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332714 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5207  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.3 
 
 
413 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114331  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1974  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.32 
 
 
467 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  32 
 
 
414 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  28.95 
 
 
387 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3290  Rieske (2Fe-2S) region  34.3 
 
 
413 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5078  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.3 
 
 
413 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27977  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.81 
 
 
387 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  31.35 
 
 
387 aa  103  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0685  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.39 
 
 
484 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2685  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  29.11 
 
 
444 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0747  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.64 
 
 
422 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  27.39 
 
 
445 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3683  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.92 
 
 
419 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804885  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3553  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.3 
 
 
413 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0463  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.39 
 
 
484 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.328369  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0835  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.64 
 
 
422 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0478  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.64 
 
 
413 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4220  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.07 
 
 
467 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0999  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.64 
 
 
422 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>