More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3695 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1788  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  67.04 
 
 
470 aa  640    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3695  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
460 aa  956    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036835  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4406  Rieske (2Fe-2S) region  68.61 
 
 
471 aa  661    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4787  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  68.61 
 
 
471 aa  661    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.819616  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4493  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  68.61 
 
 
471 aa  661    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.940392  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  67.61 
 
 
457 aa  630  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0324  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.5 
 
 
442 aa  341  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.91 
 
 
447 aa  319  7.999999999999999e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102143  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6872  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.81 
 
 
452 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.82 
 
 
447 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4719  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.76 
 
 
447 aa  237  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0908  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.61 
 
 
441 aa  210  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.48 
 
 
449 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.242613  normal  0.0404177 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0198  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.48 
 
 
449 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3715  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.5 
 
 
455 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3702  Rieske (2Fe-2S) region  29.49 
 
 
455 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.25 
 
 
469 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.49 
 
 
455 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2328  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.35 
 
 
456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459675  normal  0.238108 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3484  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.73 
 
 
469 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.93 
 
 
430 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3539  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.59 
 
 
448 aa  159  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3276  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.04 
 
 
436 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3710  Rieske (2Fe-2S) region  39.9 
 
 
425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3783  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.9 
 
 
425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0573009  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3723  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.9 
 
 
425 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6914  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.19 
 
 
431 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4184  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.78 
 
 
423 aa  153  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4357  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.93 
 
 
422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1988  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.48 
 
 
470 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2464  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.82 
 
 
425 aa  146  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31454  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.81 
 
 
423 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478644  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2976  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.47 
 
 
419 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3730  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.32 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3717  Rieske (2Fe-2S) region  35.32 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.126427  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3546  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.63 
 
 
476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3790  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.32 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.144005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.57 
 
 
423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.41 
 
 
421 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3683  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.56 
 
 
419 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804885  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4213  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.73 
 
 
444 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3505  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.85 
 
 
449 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231372  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  33.76 
 
 
387 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.1 
 
 
429 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.665588  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3376  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.12 
 
 
429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151153  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.25 
 
 
409 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136632  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2260  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.17 
 
 
448 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.33 
 
 
423 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190649  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3747  Rieske (2Fe-2S) region  35.71 
 
 
440 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00627634  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2261  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.72 
 
 
451 aa  133  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3820  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 
440 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365881  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3534  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.8 
 
 
473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.22 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2271  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.32 
 
 
443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  0.774548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2439  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.16 
 
 
449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3536  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.89 
 
 
444 aa  131  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  31.87 
 
 
434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3759  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.2 
 
 
440 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0223979  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0966  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.32 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0374518  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.23 
 
 
406 aa  126  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.63 
 
 
362 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1007  putative Rieske-type ring dioxygenase  34.42 
 
 
387 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152396  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.62 
 
 
362 aa  124  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  35.08 
 
 
414 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0973  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.65 
 
 
396 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0971663  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.16 
 
 
387 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.16 
 
 
414 aa  118  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  32.2 
 
 
387 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.94 
 
 
430 aa  117  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.97 
 
 
385 aa  117  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  27.9 
 
 
376 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.95 
 
 
430 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  31.18 
 
 
430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.44 
 
 
430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.44 
 
 
424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0911716  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  33.5 
 
 
445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.95 
 
 
430 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.65 
 
 
427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0763  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.44 
 
 
430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.89 
 
 
398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  31.1 
 
 
380 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6197  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  29.8 
 
 
429 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  29.39 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  29.8 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5070  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34 
 
 
437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192805  hitchhiker  0.00646968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0401  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  32.09 
 
 
410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0142061  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.91 
 
 
382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.5 
 
 
426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166676  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2455  Rieske (2Fe-2S) protein  27.35 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.34 
 
 
423 aa  111  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_003296  RS02037  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  31.53 
 
 
414 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4815  Rieske (2Fe-2S) region  34 
 
 
413 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2115  iron-sulphur Rieske protein  34 
 
 
413 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1861  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.5 
 
 
413 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523473  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0835  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34 
 
 
422 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0747  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34 
 
 
422 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.45 
 
 
429 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3062  iron-sulfur cluster-binding protein, rieske family  32.8 
 
 
416 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.476881  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.5 
 
 
422 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.917605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>