More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3505 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3505  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
449 aa  938    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231372  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3539  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.84 
 
 
448 aa  398  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3536  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.03 
 
 
444 aa  302  8.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2271  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.96 
 
 
443 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  0.774548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2261  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.74 
 
 
451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2260  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.22 
 
 
448 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.24 
 
 
447 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102143  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0324  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.53 
 
 
442 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3546  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.87 
 
 
476 aa  178  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6872  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.29 
 
 
452 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3484  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.81 
 
 
469 aa  172  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0908  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.34 
 
 
441 aa  170  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3534  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.66 
 
 
473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0198  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28 
 
 
449 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28 
 
 
449 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.242613  normal  0.0404177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.93 
 
 
447 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4719  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.13 
 
 
447 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3695  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.85 
 
 
460 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3715  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.78 
 
 
455 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3702  Rieske (2Fe-2S) region  24.78 
 
 
455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.78 
 
 
455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.9 
 
 
423 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478644  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2328  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.78 
 
 
456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459675  normal  0.238108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1988  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.28 
 
 
470 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.84 
 
 
457 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4406  Rieske (2Fe-2S) region  32.84 
 
 
471 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4787  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.84 
 
 
471 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.819616  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4493  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.84 
 
 
471 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.940392  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.27 
 
 
469 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1788  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.86 
 
 
470 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.42 
 
 
430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  35.91 
 
 
429 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6197  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  35.91 
 
 
429 aa  120  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3710  Rieske (2Fe-2S) region  26.87 
 
 
425 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3783  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.87 
 
 
425 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0573009  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.08 
 
 
430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  36.78 
 
 
445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3723  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.98 
 
 
425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3376  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.67 
 
 
429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151153  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0401  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  34.81 
 
 
410 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0142061  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.78 
 
 
406 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.87 
 
 
423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190649  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.67 
 
 
429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.665588  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.7 
 
 
430 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4213  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.46 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  25.65 
 
 
380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.7 
 
 
430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3747  Rieske (2Fe-2S) region  31.94 
 
 
440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00627634  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3683  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.39 
 
 
419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804885  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3820  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.94 
 
 
440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365881  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  33.15 
 
 
432 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4357  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.86 
 
 
422 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.64 
 
 
362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4071  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.72 
 
 
429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177236  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.15 
 
 
430 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.78 
 
 
423 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.252321  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42190  aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.72 
 
 
448 aa  109  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0579776  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.16 
 
 
423 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.62 
 
 
385 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.12 
 
 
423 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4184  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.88 
 
 
423 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.6 
 
 
430 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2464  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.83 
 
 
425 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31454  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  32.04 
 
 
430 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2853  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.5 
 
 
420 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3759  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.41 
 
 
440 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0223979  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0159  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.44 
 
 
340 aa  108  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3276  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.18 
 
 
436 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6914  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.18 
 
 
431 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.1 
 
 
362 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0966  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.68 
 
 
397 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0374518  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.24 
 
 
373 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3978  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.13 
 
 
410 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229993  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.63 
 
 
384 aa  106  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3717  Rieske (2Fe-2S) region  32.18 
 
 
425 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.126427  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4043  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.83 
 
 
419 aa  106  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  0.202366 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3730  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.18 
 
 
425 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3790  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.18 
 
 
425 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.144005 
 
 
-
 
NC_004310  BR1461  Rieske 2Fe-2S family protein  30.56 
 
 
405 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3082  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.6 
 
 
373 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3748  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
419 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.219388 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  29.3 
 
 
387 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1416  Rieske 2Fe-2S family protein  30.56 
 
 
405 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.98 
 
 
421 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1712  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.46 
 
 
415 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0525  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.25 
 
 
463 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110269  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4003  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.5 
 
 
419 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.11239  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  33.33 
 
 
414 aa  104  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.32 
 
 
387 aa  104  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2976  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.07 
 
 
419 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1639  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.25 
 
 
463 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.548645  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2476  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.78 
 
 
419 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.75426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0558  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.25 
 
 
463 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.559432  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  28.77 
 
 
376 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0640  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.25 
 
 
463 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.409215  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1666  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.25 
 
 
463 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5458  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.25 
 
 
447 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5639  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.25 
 
 
463 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726822  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5855  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.25 
 
 
447 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0274508  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1690  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.25 
 
 
463 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.688738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>