More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4071 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4071  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
429 aa  888    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177236  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3192  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.1 
 
 
432 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5382  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.49 
 
 
438 aa  223  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1874  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.78 
 
 
436 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.49 
 
 
443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212221  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.78 
 
 
427 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.33 
 
 
440 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000409814  normal  0.0305498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.88 
 
 
429 aa  203  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3235  putative toluate 1,2-dioxygenase alpha subunit  29.5 
 
 
446 aa  203  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7073  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.47 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0267212  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1995  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.86 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2105  putative (poly)aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit (Rieske (2Fe-2S) region)  33.49 
 
 
427 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2496  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  32.39 
 
 
427 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124288  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1502  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.37 
 
 
441 aa  194  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.409233  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2671  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.37 
 
 
441 aa  193  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4158  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  32.91 
 
 
475 aa  193  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.93 
 
 
427 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5079  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.15 
 
 
448 aa  192  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.42 
 
 
492 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1493  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.75 
 
 
437 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.507919  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.91 
 
 
427 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.91 
 
 
427 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164916  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.15 
 
 
427 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3895  ring hydroxylating dioxygenase, Rieske (2Fe-2S) protein  32.86 
 
 
423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3556  p-cumate dioxygenase large subunit (CmtAb)  31.48 
 
 
434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137255  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2679  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.45 
 
 
437 aa  190  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.91 
 
 
427 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0996141 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1391  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.11 
 
 
462 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109638  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1373  Rieske (2Fe-2S) region  31.11 
 
 
462 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.93 
 
 
456 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141435  normal  0.0753315 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  32.04 
 
 
427 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1267  Rieske (2Fe-2S) region  32.74 
 
 
460 aa  188  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.39 
 
 
418 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2898  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.75 
 
 
434 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1343  Rieske (2Fe-2S) protein  28.19 
 
 
436 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1407  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.88 
 
 
462 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0632088  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5352  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  30.61 
 
 
455 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1531  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.44 
 
 
433 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0185016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2368  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  32.37 
 
 
449 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2725  benzoate 1,2 dioxygenase, alpha subunit  31.81 
 
 
455 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2581  benzoate 1,2 dioxygenase, alpha subunit  31.81 
 
 
455 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.77 
 
 
429 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.942727 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7046  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.47 
 
 
457 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.72 
 
 
455 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0187  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  31.81 
 
 
455 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0215  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  31.81 
 
 
455 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1556  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  31.81 
 
 
455 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1360  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  31.81 
 
 
455 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1297  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  31.23 
 
 
458 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4882  benzoate 1,2-dioxygenase subunit alpha  30.03 
 
 
464 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0915  benzoate 1,2-dioxygenase subunit alpha BenA  31.04 
 
 
463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1324  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  31.5 
 
 
442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4403  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  30.16 
 
 
465 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1134  ring hydroxylating dioxygenase alpha subunit  29.21 
 
 
462 aa  172  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6131  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.55 
 
 
452 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3814  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.41 
 
 
430 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.387965  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1306  Rieske (2Fe-2S) region  32.29 
 
 
452 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32080  toluate 1,2-dioxygenase alpha subunit  30.81 
 
 
455 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6524  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.29 
 
 
452 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08590  Benzoate-1,2-dioxygenase oxygenase component, alpha subunit  29.25 
 
 
453 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2778  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  29.19 
 
 
446 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.604479  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42190  aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.43 
 
 
448 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0579776  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0473  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  30.85 
 
 
455 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1761  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.06 
 
 
470 aa  170  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.104126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2968  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  28.68 
 
 
452 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2719  benzoate 1,2-dioxygenase large subunit  29.8 
 
 
455 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602159  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3840  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.28 
 
 
450 aa  169  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3161  benzoate dioxygenase, alpha subunit  29.29 
 
 
452 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2710  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  39.09 
 
 
452 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.29 
 
 
452 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2688  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  38.1 
 
 
457 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1591  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.33 
 
 
452 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109039  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3096  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  28.5 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37570  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  30.36 
 
 
424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.925134  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.94 
 
 
452 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.174297 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6299  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.35 
 
 
452 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410726 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6584  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.35 
 
 
452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208794  normal  0.710082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2321  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  40.39 
 
 
452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3901  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.28 
 
 
459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.682799  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1177  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.36 
 
 
452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1660  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  36.86 
 
 
466 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1716  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  36.86 
 
 
466 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77849  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1689  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  36.86 
 
 
466 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.550846  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2485  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30 
 
 
447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2685  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  37.55 
 
 
444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2112  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.71 
 
 
463 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3246  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  29.12 
 
 
456 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178778  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1364  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.33 
 
 
452 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0122744  normal  0.102172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0546  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  36.44 
 
 
466 aa  161  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0537  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  36.44 
 
 
466 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689442  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1758  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.67 
 
 
428 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1680  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.55 
 
 
447 aa  160  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0683  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.31 
 
 
424 aa  160  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.73 
 
 
452 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0496525  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2690  3-phenylpropionate dioxygenase alpha subunit  28.03 
 
 
453 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.163483  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0567  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  35.8 
 
 
458 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0662  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  35.8 
 
 
455 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2237  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  35.8 
 
 
458 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1130  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit-like protein  28.03 
 
 
453 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2691  3-phenylpropionate dioxygenase alpha subunit  28.03 
 
 
453 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.244955  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>