More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2679 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2679  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
437 aa  924    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1493  Rieske (2Fe-2S) domain protein  90.16 
 
 
437 aa  850    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.507919  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1502  Rieske (2Fe-2S) domain protein  56.06 
 
 
441 aa  557  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.409233  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2671  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  54.23 
 
 
441 aa  533  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3235  putative toluate 1,2-dioxygenase alpha subunit  53.88 
 
 
446 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1343  Rieske (2Fe-2S) protein  54.33 
 
 
436 aa  496  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5382  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.08 
 
 
438 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1874  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.41 
 
 
436 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1995  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.16 
 
 
450 aa  354  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.41 
 
 
455 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7073  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  40.69 
 
 
445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0267212  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.55 
 
 
440 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000409814  normal  0.0305498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1531  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.88 
 
 
433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0185016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4071  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.32 
 
 
429 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177236  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1267  Rieske (2Fe-2S) region  31.22 
 
 
460 aa  187  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6299  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.75 
 
 
452 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410726 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.3 
 
 
443 aa  187  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3192  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.82 
 
 
432 aa  186  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08590  Benzoate-1,2-dioxygenase oxygenase component, alpha subunit  29.13 
 
 
453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6584  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.49 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208794  normal  0.710082 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3096  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  28.75 
 
 
444 aa  182  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0538  Rieske (2Fe-2S) protein  30.05 
 
 
444 aa  182  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.71 
 
 
452 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.174297 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7046  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.31 
 
 
457 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296981 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6131  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.23 
 
 
452 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1591  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.69 
 
 
452 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109039  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2778  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  28.54 
 
 
446 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.604479  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1306  Rieske (2Fe-2S) region  29.97 
 
 
452 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6524  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.97 
 
 
452 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1364  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.97 
 
 
452 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0122744  normal  0.102172 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2968  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  28.78 
 
 
452 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1177  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.14 
 
 
452 aa  176  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.72 
 
 
452 aa  176  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0496525  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2719  benzoate 1,2-dioxygenase large subunit  27.54 
 
 
455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602159  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  29.77 
 
 
427 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3161  benzoate dioxygenase, alpha subunit  28.11 
 
 
452 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2321  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  28.11 
 
 
452 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.11 
 
 
452 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5079  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.45 
 
 
448 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2688  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  28.36 
 
 
457 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.61 
 
 
427 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.38 
 
 
427 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164916  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2496  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  29.16 
 
 
427 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124288  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2710  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  27.61 
 
 
452 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5352  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  29.27 
 
 
455 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587151 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.56 
 
 
427 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0996141 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1761  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.68 
 
 
470 aa  169  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.104126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4158  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  27.76 
 
 
475 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32080  toluate 1,2-dioxygenase alpha subunit  27.9 
 
 
455 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2112  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.86 
 
 
463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4882  benzoate 1,2-dioxygenase subunit alpha  28.21 
 
 
464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.33 
 
 
427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.37 
 
 
427 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2105  putative (poly)aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit (Rieske (2Fe-2S) region)  30.77 
 
 
427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4403  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  27.95 
 
 
465 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1297  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  27.92 
 
 
458 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2634  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  28.05 
 
 
450 aa  163  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2368  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  27.34 
 
 
449 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.6 
 
 
456 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141435  normal  0.0753315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1324  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  26.93 
 
 
442 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.08 
 
 
492 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2725  benzoate 1,2 dioxygenase, alpha subunit  28.05 
 
 
455 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2581  benzoate 1,2 dioxygenase, alpha subunit  28.05 
 
 
455 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1134  ring hydroxylating dioxygenase alpha subunit  27.32 
 
 
462 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1556  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  28.05 
 
 
455 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0187  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  28.05 
 
 
455 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1360  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  28.05 
 
 
455 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0473  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  27.53 
 
 
455 aa  159  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0215  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  28.05 
 
 
455 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4415  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.65 
 
 
446 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0890  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.28 
 
 
497 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145074  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0435  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit-like protein  28.92 
 
 
427 aa  156  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00493775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3246  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  26.7 
 
 
456 aa  156  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178778  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0915  benzoate 1,2-dioxygenase subunit alpha BenA  26.74 
 
 
463 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1373  Rieske (2Fe-2S) region  26.56 
 
 
462 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32160  anthranilate dioxygenase large subunit  29.29 
 
 
464 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243379  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1391  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.56 
 
 
462 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109638  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.19 
 
 
427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2725  anthranilate 1,2-dioxygenase, large subunit  28.79 
 
 
464 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42190  aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.02 
 
 
448 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0579776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1407  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.3 
 
 
462 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0632088  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2690  3-phenylpropionate dioxygenase alpha subunit  27.62 
 
 
453 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.163483  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2691  3-phenylpropionate dioxygenase alpha subunit  27.62 
 
 
453 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.244955  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02430  3-phenylpropionate dioxygenase, large (alpha) subunit  27.62 
 
 
453 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1130  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit-like protein  27.62 
 
 
453 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02394  hypothetical protein  27.62 
 
 
453 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1139  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit-like protein  27.62 
 
 
453 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1680  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.09 
 
 
447 aa  150  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.44 
 
 
429 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.59 
 
 
429 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.942727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2685  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  27.92 
 
 
444 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3895  ring hydroxylating dioxygenase, Rieske (2Fe-2S) protein  25.96 
 
 
423 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4346  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.82 
 
 
505 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23778  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0537  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  26.5 
 
 
466 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689442  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1690  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.49 
 
 
463 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1639  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.49 
 
 
463 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.548645  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5458  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.49 
 
 
447 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0640  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.49 
 
 
463 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.409215  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5639  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.49 
 
 
463 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726822  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5855  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.49 
 
 
447 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0274508  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>