More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1306 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6299  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  94.47 
 
 
452 aa  905    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410726 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7046  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  95.8 
 
 
457 aa  918    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296981 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0538  Rieske (2Fe-2S) protein  69.27 
 
 
444 aa  660    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2634  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  67.13 
 
 
450 aa  646    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1306  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
452 aa  953    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1591  Rieske (2Fe-2S) domain protein  86.5 
 
 
452 aa  851    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109039  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6584  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  94.47 
 
 
452 aa  902    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208794  normal  0.710082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1364  Rieske (2Fe-2S) domain protein  89.82 
 
 
452 aa  865    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0122744  normal  0.102172 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  88.05 
 
 
452 aa  845    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0496525  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6524  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
452 aa  953    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1177  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  80.09 
 
 
452 aa  787    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  90.04 
 
 
452 aa  872    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.174297 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6131  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  99.56 
 
 
452 aa  950    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2368  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  64.37 
 
 
449 aa  619  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1134  ring hydroxylating dioxygenase alpha subunit  62.7 
 
 
462 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3161  benzoate dioxygenase, alpha subunit  63.62 
 
 
452 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1324  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  63.01 
 
 
442 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4882  benzoate 1,2-dioxygenase subunit alpha  63.3 
 
 
464 aa  608  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.62 
 
 
452 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08590  Benzoate-1,2-dioxygenase oxygenase component, alpha subunit  61.2 
 
 
453 aa  605  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2688  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  63.62 
 
 
457 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2112  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.25 
 
 
463 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4403  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  62.5 
 
 
465 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2710  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  62.01 
 
 
452 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0915  benzoate 1,2-dioxygenase subunit alpha BenA  63.33 
 
 
463 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2778  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  61.36 
 
 
446 aa  598  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.604479  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0473  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  63.24 
 
 
455 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5352  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  62.42 
 
 
455 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2968  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  62.01 
 
 
452 aa  597  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0187  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  63.66 
 
 
455 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1556  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  63.66 
 
 
455 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0215  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  63.66 
 
 
455 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2725  benzoate 1,2 dioxygenase, alpha subunit  63.43 
 
 
455 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2719  benzoate 1,2-dioxygenase large subunit  59.73 
 
 
455 aa  591  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602159  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1360  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  63.66 
 
 
455 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2581  benzoate 1,2 dioxygenase, alpha subunit  63.43 
 
 
455 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2321  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  60.31 
 
 
452 aa  590  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3096  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  62.27 
 
 
444 aa  589  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32080  toluate 1,2-dioxygenase alpha subunit  60.18 
 
 
455 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1267  Rieske (2Fe-2S) region  58.96 
 
 
460 aa  576  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1297  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  59.25 
 
 
458 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.32 
 
 
456 aa  561  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141435  normal  0.0753315 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1391  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  57.65 
 
 
462 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109638  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1407  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.13 
 
 
462 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0632088  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1373  Rieske (2Fe-2S) region  57.65 
 
 
462 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4158  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  58.16 
 
 
475 aa  538  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1761  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.1 
 
 
470 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.104126 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.44 
 
 
492 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32160  anthranilate dioxygenase large subunit  47.71 
 
 
464 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243379  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2725  anthranilate 1,2-dioxygenase, large subunit  46.67 
 
 
464 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1680  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  37.13 
 
 
447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1758  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.58 
 
 
428 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.38 
 
 
443 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37570  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  31.76 
 
 
424 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.925134  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5382  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.16 
 
 
438 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3556  p-cumate dioxygenase large subunit (CmtAb)  30.96 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137255  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2898  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.46 
 
 
434 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.34 
 
 
429 aa  199  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.1 
 
 
418 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1874  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.58 
 
 
436 aa  193  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3192  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.56 
 
 
432 aa  193  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1531  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.38 
 
 
433 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0185016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1493  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.5 
 
 
437 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.507919  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  30.46 
 
 
427 aa  186  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3895  ring hydroxylating dioxygenase, Rieske (2Fe-2S) protein  29.32 
 
 
423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2105  putative (poly)aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit (Rieske (2Fe-2S) region)  30.2 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.64 
 
 
427 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0546  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.35 
 
 
466 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2496  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  30.54 
 
 
427 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124288  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.56 
 
 
427 aa  183  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0996141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.85 
 
 
427 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.81 
 
 
427 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.81 
 
 
427 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.81 
 
 
427 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164916  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0537  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.63 
 
 
466 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689442  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5079  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.02 
 
 
448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3235  putative toluate 1,2-dioxygenase alpha subunit  32.03 
 
 
446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.55 
 
 
429 aa  180  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.942727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2679  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.97 
 
 
437 aa  179  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.45 
 
 
440 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000409814  normal  0.0305498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1660  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.11 
 
 
466 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1689  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.11 
 
 
466 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.550846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1716  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.11 
 
 
466 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77849  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3814  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.4 
 
 
430 aa  177  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.387965  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4071  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.29 
 
 
429 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177236  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3840  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.46 
 
 
450 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0890  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.24 
 
 
497 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145074  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1343  Rieske (2Fe-2S) protein  29.43 
 
 
436 aa  166  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4415  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.95 
 
 
446 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4897  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.47 
 
 
435 aa  163  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.227325  normal  0.4666 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1995  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
450 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3842  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.04 
 
 
455 aa  160  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7073  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.83 
 
 
445 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0267212  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2685  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  28.33 
 
 
444 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4363  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  26.67 
 
 
487 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000470921  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5458  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  27.25 
 
 
447 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5855  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  27.25 
 
 
447 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0274508  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1639  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  26.98 
 
 
463 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.548645  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1690  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  26.98 
 
 
463 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1197  biphenyl 2,3-dioxygenase alpha subunit (BphA1)  28.61 
 
 
459 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>