More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3901 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  85.92 
 
 
427 aa  788    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5079  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  95.07 
 
 
448 aa  852    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2496  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  97.42 
 
 
427 aa  872    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124288  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  90.38 
 
 
427 aa  813    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2105  putative (poly)aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit (Rieske (2Fe-2S) region)  84.51 
 
 
427 aa  779    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  97.65 
 
 
427 aa  870    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0996141 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
427 aa  890    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  97.65 
 
 
427 aa  870    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  99.77 
 
 
427 aa  889    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164916  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  61.37 
 
 
427 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.13 
 
 
429 aa  525  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3895  ring hydroxylating dioxygenase, Rieske (2Fe-2S) protein  58.54 
 
 
423 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.64 
 
 
418 aa  498  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  55.92 
 
 
429 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.942727 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3814  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  56.07 
 
 
430 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.387965  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.93 
 
 
443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3192  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  35.38 
 
 
432 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2725  anthranilate 1,2-dioxygenase, large subunit  33.25 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2112  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.86 
 
 
463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.75 
 
 
492 aa  200  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1761  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.34 
 
 
470 aa  199  9e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.104126 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08590  Benzoate-1,2-dioxygenase oxygenase component, alpha subunit  32.99 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1267  Rieske (2Fe-2S) region  32.61 
 
 
460 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1134  ring hydroxylating dioxygenase alpha subunit  33.96 
 
 
462 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32160  anthranilate dioxygenase large subunit  33.42 
 
 
464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243379  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1680  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.1 
 
 
447 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.42 
 
 
440 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000409814  normal  0.0305498 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4403  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  33.06 
 
 
465 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2898  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.22 
 
 
434 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3556  p-cumate dioxygenase large subunit (CmtAb)  31.01 
 
 
434 aa  192  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137255  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2368  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  33.06 
 
 
449 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4071  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.91 
 
 
429 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177236  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3096  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  33.33 
 
 
444 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4882  benzoate 1,2-dioxygenase subunit alpha  32.8 
 
 
464 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1531  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.68 
 
 
433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0185016 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5382  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.02 
 
 
438 aa  190  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6299  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.89 
 
 
452 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410726 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5352  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  31.81 
 
 
455 aa  189  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0538  Rieske (2Fe-2S) protein  33.42 
 
 
444 aa  188  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.16 
 
 
452 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.174297 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1556  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  32.43 
 
 
455 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0187  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  32.43 
 
 
455 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2321  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  33.6 
 
 
452 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2968  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  33.33 
 
 
452 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2719  benzoate 1,2-dioxygenase large subunit  32.61 
 
 
455 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602159  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0915  benzoate 1,2-dioxygenase subunit alpha BenA  32.97 
 
 
463 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2581  benzoate 1,2 dioxygenase, alpha subunit  32.43 
 
 
455 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1197  biphenyl 2,3-dioxygenase alpha subunit (BphA1)  30.5 
 
 
459 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1360  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  32.43 
 
 
455 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1591  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.55 
 
 
452 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109039  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0215  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  32.43 
 
 
455 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6584  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.62 
 
 
452 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208794  normal  0.710082 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2725  benzoate 1,2 dioxygenase, alpha subunit  32.43 
 
 
455 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2634  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  33.25 
 
 
450 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3161  benzoate dioxygenase, alpha subunit  33.24 
 
 
452 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2710  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  33.24 
 
 
452 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0473  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  31.89 
 
 
455 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.24 
 
 
452 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4152  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.4 
 
 
456 aa  186  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.424226  normal  0.388878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2688  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  32.45 
 
 
457 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37570  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  32.93 
 
 
424 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.925134  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1364  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.16 
 
 
452 aa  186  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0122744  normal  0.102172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1324  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  32.97 
 
 
442 aa  186  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.89 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0496525  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1177  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.98 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1297  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  32.69 
 
 
458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6131  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.08 
 
 
452 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2690  3-phenylpropionate dioxygenase alpha subunit  30.04 
 
 
453 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.163483  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1306  Rieske (2Fe-2S) region  30.81 
 
 
452 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6524  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.81 
 
 
452 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32080  toluate 1,2-dioxygenase alpha subunit  32.07 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02430  3-phenylpropionate dioxygenase, large (alpha) subunit  29.82 
 
 
453 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1130  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit-like protein  29.82 
 
 
453 aa  180  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5610  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.9 
 
 
438 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02394  hypothetical protein  29.82 
 
 
453 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.9 
 
 
438 aa  180  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1653  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.9 
 
 
438 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1139  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit-like protein  29.82 
 
 
453 aa  180  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0539  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.9 
 
 
438 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0984806  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1680  Rieske (2Fe-2S) region  30.9 
 
 
438 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.9 
 
 
438 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0626  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.9 
 
 
438 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2691  3-phenylpropionate dioxygenase alpha subunit  29.82 
 
 
453 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.244955  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7046  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.54 
 
 
457 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2778  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  32.74 
 
 
446 aa  179  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.604479  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5838  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.66 
 
 
438 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1481  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5441  Rieske (2Fe-2S) region  30.66 
 
 
438 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0352555  normal  0.90702 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4719  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  31.44 
 
 
417 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1391  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.43 
 
 
462 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109638  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1107  ortho-halobenzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  33.25 
 
 
428 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1373  Rieske (2Fe-2S) region  32.43 
 
 
462 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1493  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.77 
 
 
437 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.507919  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4363  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.07 
 
 
487 aa  176  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000470921  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1874  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.29 
 
 
436 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4158  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  29.8 
 
 
475 aa  173  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.05 
 
 
455 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1407  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.16 
 
 
462 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0632088  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4346  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.96 
 
 
505 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23778  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.05 
 
 
456 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141435  normal  0.0753315 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7073  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.25 
 
 
445 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0267212  normal  0.924215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>