More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0538 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_1364  Rieske (2Fe-2S) domain protein  70.78 
 
 
452 aa  680    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0122744  normal  0.102172 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  69.84 
 
 
452 aa  668    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.174297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2634  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  77.93 
 
 
450 aa  760    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1591  Rieske (2Fe-2S) domain protein  67.73 
 
 
452 aa  656    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109039  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  70.52 
 
 
452 aa  681    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0496525  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6299  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  69.02 
 
 
452 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410726 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6131  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  69.04 
 
 
452 aa  660    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7046  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  69.27 
 
 
457 aa  663    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296981 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0538  Rieske (2Fe-2S) protein  100 
 
 
444 aa  924    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1306  Rieske (2Fe-2S) region  69.27 
 
 
452 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6584  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  68.56 
 
 
452 aa  656    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208794  normal  0.710082 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6524  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  69.27 
 
 
452 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1177  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.77 
 
 
452 aa  685    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2368  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  65.16 
 
 
449 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1324  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  63.72 
 
 
442 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3161  benzoate dioxygenase, alpha subunit  62.64 
 
 
452 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.64 
 
 
452 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1134  ring hydroxylating dioxygenase alpha subunit  61.94 
 
 
462 aa  596  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2968  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  62.87 
 
 
452 aa  595  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2710  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  62.87 
 
 
452 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2688  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  62.64 
 
 
457 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2719  benzoate 1,2-dioxygenase large subunit  62.01 
 
 
455 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602159  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2321  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  62.41 
 
 
452 aa  587  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08590  Benzoate-1,2-dioxygenase oxygenase component, alpha subunit  60.23 
 
 
453 aa  578  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4882  benzoate 1,2-dioxygenase subunit alpha  60.32 
 
 
464 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2112  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.84 
 
 
463 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5352  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  60.27 
 
 
455 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587151 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32080  toluate 1,2-dioxygenase alpha subunit  61.7 
 
 
455 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1360  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  59.64 
 
 
455 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0187  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  59.64 
 
 
455 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0473  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  59.86 
 
 
455 aa  571  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1556  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  59.64 
 
 
455 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0915  benzoate 1,2-dioxygenase subunit alpha BenA  59.51 
 
 
463 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0215  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  59.64 
 
 
455 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4403  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  58.68 
 
 
465 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2581  benzoate 1,2 dioxygenase, alpha subunit  59.41 
 
 
455 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2725  benzoate 1,2 dioxygenase, alpha subunit  59.41 
 
 
455 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1373  Rieske (2Fe-2S) region  57.92 
 
 
462 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1391  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  57.92 
 
 
462 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109638  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1407  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.14 
 
 
462 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0632088  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2778  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  57.79 
 
 
446 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.604479  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1297  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  58.71 
 
 
458 aa  556  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3096  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  58.53 
 
 
444 aa  547  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.99 
 
 
456 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141435  normal  0.0753315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4158  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  59.62 
 
 
475 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1267  Rieske (2Fe-2S) region  52.73 
 
 
460 aa  512  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1761  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.55 
 
 
470 aa  465  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.104126 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50 
 
 
492 aa  440  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2725  anthranilate 1,2-dioxygenase, large subunit  45.31 
 
 
464 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32160  anthranilate dioxygenase large subunit  45.54 
 
 
464 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243379  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1680  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  39.06 
 
 
447 aa  341  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1758  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  34.67 
 
 
428 aa  246  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.65 
 
 
418 aa  209  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3556  p-cumate dioxygenase large subunit (CmtAb)  30.23 
 
 
434 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137255  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37570  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  32.82 
 
 
424 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.925134  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5382  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.36 
 
 
438 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1531  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.5 
 
 
433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0185016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2898  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.08 
 
 
429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.64 
 
 
429 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.942727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.47 
 
 
443 aa  197  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212221  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2105  putative (poly)aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit (Rieske (2Fe-2S) region)  32.57 
 
 
427 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.49 
 
 
427 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2496  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  33.93 
 
 
427 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124288  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  32.49 
 
 
427 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.25 
 
 
427 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3814  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.62 
 
 
430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.387965  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.42 
 
 
427 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3192  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.41 
 
 
432 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.25 
 
 
427 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0996141 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.42 
 
 
427 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1493  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.08 
 
 
437 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.507919  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3895  ring hydroxylating dioxygenase, Rieske (2Fe-2S) protein  30.9 
 
 
423 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5079  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.51 
 
 
448 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.42 
 
 
427 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164916  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2679  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.05 
 
 
437 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1874  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.07 
 
 
436 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.94 
 
 
440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000409814  normal  0.0305498 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3840  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.97 
 
 
450 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2690  3-phenylpropionate dioxygenase alpha subunit  30.18 
 
 
453 aa  170  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.163483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02430  3-phenylpropionate dioxygenase, large (alpha) subunit  30.18 
 
 
453 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1130  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit-like protein  30.18 
 
 
453 aa  170  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02394  hypothetical protein  30.18 
 
 
453 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1139  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit-like protein  30.18 
 
 
453 aa  170  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2691  3-phenylpropionate dioxygenase alpha subunit  30.18 
 
 
453 aa  170  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.244955  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4415  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.19 
 
 
446 aa  169  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3235  putative toluate 1,2-dioxygenase alpha subunit  29.31 
 
 
446 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0890  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.03 
 
 
497 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145074  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3246  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  30.39 
 
 
456 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178778  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4897  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.56 
 
 
435 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.227325  normal  0.4666 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2685  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  30.39 
 
 
444 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4588  Rieske (2Fe-2S) region  32.58 
 
 
435 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.818031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.58 
 
 
435 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487989  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3667  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.16 
 
 
429 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2325  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  32.16 
 
 
435 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3748  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.58 
 
 
423 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171492  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1502  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28 
 
 
441 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.409233  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.89 
 
 
444 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261439  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3842  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.49 
 
 
455 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7073  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.43 
 
 
445 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0267212  normal  0.924215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>