More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2634 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6299  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.51 
 
 
452 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410726 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6131  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  67.13 
 
 
452 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7046  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  66.44 
 
 
457 aa  643    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296981 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0538  Rieske (2Fe-2S) protein  77.93 
 
 
444 aa  760    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1306  Rieske (2Fe-2S) region  67.13 
 
 
452 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1591  Rieske (2Fe-2S) domain protein  67.59 
 
 
452 aa  650    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109039  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  67.96 
 
 
452 aa  656    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.174297 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1364  Rieske (2Fe-2S) domain protein  69.5 
 
 
452 aa  673    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0122744  normal  0.102172 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6584  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.29 
 
 
452 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208794  normal  0.710082 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  69.04 
 
 
452 aa  669    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0496525  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6524  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  67.13 
 
 
452 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1177  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  71.4 
 
 
452 aa  681    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2634  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  100 
 
 
450 aa  933    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2368  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  63.84 
 
 
449 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1324  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  63.84 
 
 
442 aa  600  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2719  benzoate 1,2-dioxygenase large subunit  62.33 
 
 
455 aa  598  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602159  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1134  ring hydroxylating dioxygenase alpha subunit  62.73 
 
 
462 aa  592  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32080  toluate 1,2-dioxygenase alpha subunit  62.1 
 
 
455 aa  584  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2710  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  60.04 
 
 
452 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3161  benzoate dioxygenase, alpha subunit  59.82 
 
 
452 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.82 
 
 
452 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08590  Benzoate-1,2-dioxygenase oxygenase component, alpha subunit  58.8 
 
 
453 aa  576  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2688  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  59.6 
 
 
457 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2968  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  58.71 
 
 
452 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2321  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  58.15 
 
 
452 aa  568  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2112  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  57.05 
 
 
463 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0915  benzoate 1,2-dioxygenase subunit alpha BenA  58.17 
 
 
463 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4882  benzoate 1,2-dioxygenase subunit alpha  58.58 
 
 
464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1391  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.68 
 
 
462 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109638  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1407  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.91 
 
 
462 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0632088  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1373  Rieske (2Fe-2S) region  59.68 
 
 
462 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3096  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  59.63 
 
 
444 aa  555  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2778  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  58.62 
 
 
446 aa  555  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.604479  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1297  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  58.43 
 
 
458 aa  551  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4403  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  57.98 
 
 
465 aa  551  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0473  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  59.86 
 
 
455 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5352  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  58.35 
 
 
455 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587151 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1360  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  58.35 
 
 
455 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2581  benzoate 1,2 dioxygenase, alpha subunit  58.12 
 
 
455 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0187  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  58.35 
 
 
455 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2725  benzoate 1,2 dioxygenase, alpha subunit  58.12 
 
 
455 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0215  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  58.35 
 
 
455 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1556  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  58.35 
 
 
455 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.45 
 
 
456 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141435  normal  0.0753315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4158  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  59.39 
 
 
475 aa  534  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1267  Rieske (2Fe-2S) region  54.99 
 
 
460 aa  521  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1761  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.78 
 
 
470 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.104126 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.89 
 
 
492 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2725  anthranilate 1,2-dioxygenase, large subunit  46.55 
 
 
464 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32160  anthranilate dioxygenase large subunit  46.55 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243379  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1680  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  41.14 
 
 
447 aa  352  1e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1758  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.74 
 
 
428 aa  242  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3556  p-cumate dioxygenase large subunit (CmtAb)  32.23 
 
 
434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137255  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2898  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.73 
 
 
434 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37570  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  32.92 
 
 
424 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.925134  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.26 
 
 
429 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1531  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.87 
 
 
433 aa  206  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0185016 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5382  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.04 
 
 
438 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.82 
 
 
427 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.93 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.96 
 
 
443 aa  201  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212221  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3895  ring hydroxylating dioxygenase, Rieske (2Fe-2S) protein  31.75 
 
 
423 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2105  putative (poly)aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit (Rieske (2Fe-2S) region)  31.34 
 
 
427 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.09 
 
 
427 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3814  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.11 
 
 
430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.387965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1874  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.45 
 
 
436 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.81 
 
 
427 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  31.82 
 
 
427 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.25 
 
 
427 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.55 
 
 
427 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0996141 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2496  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 
427 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124288  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.25 
 
 
427 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164916  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3192  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.07 
 
 
432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.93 
 
 
429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.942727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3235  putative toluate 1,2-dioxygenase alpha subunit  31.24 
 
 
446 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5079  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.6 
 
 
448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.25 
 
 
440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000409814  normal  0.0305498 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3840  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.65 
 
 
450 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4415  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.33 
 
 
446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1493  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.85 
 
 
437 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.507919  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7073  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.73 
 
 
445 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0267212  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3842  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.78 
 
 
455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1343  Rieske (2Fe-2S) protein  30.05 
 
 
436 aa  165  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2679  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.05 
 
 
437 aa  163  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1502  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.23 
 
 
441 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.409233  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2685  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  29.16 
 
 
444 aa  161  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3901  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.45 
 
 
459 aa  161  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.682799  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0632  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.1 
 
 
471 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647669  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0890  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.72 
 
 
497 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145074  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5647  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.1 
 
 
471 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1647  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.1 
 
 
471 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355106  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0550  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.1 
 
 
471 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1673  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.1 
 
 
471 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1698  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.1 
 
 
471 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.362681 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5450  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.1 
 
 
471 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5847  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.1 
 
 
467 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0153324  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0533  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.1 
 
 
471 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.379734  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2690  3-phenylpropionate dioxygenase alpha subunit  28.73 
 
 
453 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.163483  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1130  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit-like protein  28.73 
 
 
453 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1139  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit-like protein  28.73 
 
 
453 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>