More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1407 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4158  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  85.81 
 
 
475 aa  791    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  86.26 
 
 
456 aa  813    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141435  normal  0.0753315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1134  ring hydroxylating dioxygenase alpha subunit  66.82 
 
 
462 aa  636    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1373  Rieske (2Fe-2S) region  99.35 
 
 
462 aa  965    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2368  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  68.11 
 
 
449 aa  657    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1391  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  99.35 
 
 
462 aa  965    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109638  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1297  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  85.45 
 
 
458 aa  795    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1407  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
462 aa  971    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0632088  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1324  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  69.18 
 
 
442 aa  657    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2778  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  64.38 
 
 
446 aa  619  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.604479  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4403  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  63.66 
 
 
465 aa  618  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2725  benzoate 1,2 dioxygenase, alpha subunit  65.38 
 
 
455 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2581  benzoate 1,2 dioxygenase, alpha subunit  65.38 
 
 
455 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1360  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  65.16 
 
 
455 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0187  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  65.16 
 
 
455 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1556  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  65.16 
 
 
455 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0473  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  64.6 
 
 
455 aa  614  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0215  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  65.16 
 
 
455 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3161  benzoate dioxygenase, alpha subunit  64.95 
 
 
452 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  64.95 
 
 
452 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2112  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.44 
 
 
463 aa  608  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2688  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  64.95 
 
 
457 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2968  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  64.87 
 
 
452 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4882  benzoate 1,2-dioxygenase subunit alpha  61.95 
 
 
464 aa  605  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2719  benzoate 1,2-dioxygenase large subunit  62.59 
 
 
455 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602159  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0915  benzoate 1,2-dioxygenase subunit alpha BenA  63.16 
 
 
463 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2710  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  64.49 
 
 
452 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08590  Benzoate-1,2-dioxygenase oxygenase component, alpha subunit  64.6 
 
 
453 aa  596  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2321  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  63.89 
 
 
452 aa  596  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32080  toluate 1,2-dioxygenase alpha subunit  61.73 
 
 
455 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5352  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  62.56 
 
 
455 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587151 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1177  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.75 
 
 
452 aa  589  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3096  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  63.18 
 
 
444 aa  585  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1364  Rieske (2Fe-2S) domain protein  60.09 
 
 
452 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0122744  normal  0.102172 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  60.09 
 
 
452 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0496525  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.55 
 
 
452 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.174297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1267  Rieske (2Fe-2S) region  58.6 
 
 
460 aa  570  1e-161  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1591  Rieske (2Fe-2S) domain protein  59.69 
 
 
452 aa  571  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109039  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6299  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.8 
 
 
452 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410726 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7046  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  57.87 
 
 
457 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296981 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0538  Rieske (2Fe-2S) protein  58.14 
 
 
444 aa  559  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2634  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  59.91 
 
 
450 aa  560  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6584  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.8 
 
 
452 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208794  normal  0.710082 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6131  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  57.91 
 
 
452 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1306  Rieske (2Fe-2S) region  58.13 
 
 
452 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6524  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.13 
 
 
452 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1761  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.31 
 
 
470 aa  455  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.104126 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.64 
 
 
492 aa  445  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32160  anthranilate dioxygenase large subunit  47.07 
 
 
464 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243379  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2725  anthranilate 1,2-dioxygenase, large subunit  46.71 
 
 
464 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1680  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  39.19 
 
 
447 aa  335  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1758  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.14 
 
 
428 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2898  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.73 
 
 
434 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3556  p-cumate dioxygenase large subunit (CmtAb)  32.72 
 
 
434 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137255  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.73 
 
 
440 aa  209  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000409814  normal  0.0305498 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.71 
 
 
443 aa  208  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37570  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  31.3 
 
 
424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.925134  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1531  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.03 
 
 
433 aa  199  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0185016 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5382  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.11 
 
 
438 aa  197  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.76 
 
 
429 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.942727 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.76 
 
 
418 aa  186  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1874  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.25 
 
 
436 aa  186  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.03 
 
 
427 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4071  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.88 
 
 
429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177236  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.43 
 
 
427 aa  183  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3192  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.46 
 
 
432 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.84 
 
 
429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2105  putative (poly)aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit (Rieske (2Fe-2S) region)  31.44 
 
 
427 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5079  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.88 
 
 
448 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  32.14 
 
 
427 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.16 
 
 
427 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0996141 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.79 
 
 
427 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3814  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.59 
 
 
430 aa  175  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.387965  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2496  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  30.85 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124288  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3235  putative toluate 1,2-dioxygenase alpha subunit  30.61 
 
 
446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.16 
 
 
427 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.16 
 
 
427 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164916  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.01 
 
 
455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4363  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30 
 
 
487 aa  167  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000470921  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0890  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.12 
 
 
497 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145074  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3895  ring hydroxylating dioxygenase, Rieske (2Fe-2S) protein  28.78 
 
 
423 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2881  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.82 
 
 
450 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.912394  normal  0.0432092 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5847  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.39 
 
 
467 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0153324  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5450  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.39 
 
 
471 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1595  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.91 
 
 
483 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5647  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.52 
 
 
471 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0632  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.52 
 
 
471 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647669  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1622  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.91 
 
 
484 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0299575  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0550  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.52 
 
 
471 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1673  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.52 
 
 
471 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1647  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.52 
 
 
471 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355106  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1698  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.52 
 
 
471 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.362681 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1647  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.91 
 
 
484 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0595  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.91 
 
 
483 aa  159  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7073  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.61 
 
 
445 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0267212  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4220  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30 
 
 
467 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0533  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.13 
 
 
471 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.379734  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3840  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  27.56 
 
 
450 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1493  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.56 
 
 
437 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.507919  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0537  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  27.88 
 
 
466 aa  156  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689442  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>