More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2719 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3161  benzoate dioxygenase, alpha subunit  80.63 
 
 
452 aa  790    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1556  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  73.58 
 
 
455 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2112  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.54 
 
 
463 aa  695    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1360  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  73.58 
 
 
455 aa  691    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1134  ring hydroxylating dioxygenase alpha subunit  73.12 
 
 
462 aa  699    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0187  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  73.58 
 
 
455 aa  691    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2368  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  73.18 
 
 
449 aa  709    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2778  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  70.5 
 
 
446 aa  693    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.604479  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4403  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  72.54 
 
 
465 aa  688    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2321  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  83.83 
 
 
452 aa  803    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2968  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  83.11 
 
 
452 aa  807    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2710  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  81.76 
 
 
452 aa  793    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5352  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  74.09 
 
 
455 aa  688    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587151 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0473  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  73.46 
 
 
455 aa  687    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2581  benzoate 1,2 dioxygenase, alpha subunit  73.35 
 
 
455 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0215  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  73.58 
 
 
455 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2725  benzoate 1,2 dioxygenase, alpha subunit  73.35 
 
 
455 aa  689    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0915  benzoate 1,2-dioxygenase subunit alpha BenA  72.3 
 
 
463 aa  687    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2719  benzoate 1,2-dioxygenase large subunit  100 
 
 
455 aa  946    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602159  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1267  Rieske (2Fe-2S) region  66.59 
 
 
460 aa  651    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4882  benzoate 1,2-dioxygenase subunit alpha  73.39 
 
 
464 aa  685    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3096  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  71.62 
 
 
444 aa  679    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  80.63 
 
 
452 aa  790    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08590  Benzoate-1,2-dioxygenase oxygenase component, alpha subunit  71.56 
 
 
453 aa  701    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1324  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  72.73 
 
 
442 aa  695    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2688  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  80.18 
 
 
457 aa  786    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32080  toluate 1,2-dioxygenase alpha subunit  95.6 
 
 
455 aa  894    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1407  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.59 
 
 
462 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0632088  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1591  Rieske (2Fe-2S) domain protein  60.59 
 
 
452 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109039  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1391  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.36 
 
 
462 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109638  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1373  Rieske (2Fe-2S) region  62.36 
 
 
462 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1364  Rieske (2Fe-2S) domain protein  62.56 
 
 
452 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0122744  normal  0.102172 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.27 
 
 
452 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.174297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2634  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  62.33 
 
 
450 aa  598  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1177  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.5 
 
 
452 aa  600  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1297  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  63.39 
 
 
458 aa  597  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.81 
 
 
456 aa  595  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141435  normal  0.0753315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  62.09 
 
 
452 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0496525  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6131  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.55 
 
 
452 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1306  Rieske (2Fe-2S) region  59.73 
 
 
452 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6524  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.73 
 
 
452 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6299  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.23 
 
 
452 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410726 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7046  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  60 
 
 
457 aa  590  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296981 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0538  Rieske (2Fe-2S) protein  62.01 
 
 
444 aa  589  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6584  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.55 
 
 
452 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208794  normal  0.710082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4158  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  62.18 
 
 
475 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1761  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.69 
 
 
470 aa  484  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.104126 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50 
 
 
492 aa  461  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2725  anthranilate 1,2-dioxygenase, large subunit  48.57 
 
 
464 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32160  anthranilate dioxygenase large subunit  49.33 
 
 
464 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243379  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1680  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  42.36 
 
 
447 aa  364  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.7 
 
 
443 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212221  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1758  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.46 
 
 
428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2898  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.4 
 
 
434 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3556  p-cumate dioxygenase large subunit (CmtAb)  30.81 
 
 
434 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137255  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1531  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.99 
 
 
433 aa  209  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0185016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37570  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  30.25 
 
 
424 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.925134  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3192  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.11 
 
 
432 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.22 
 
 
418 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5382  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.82 
 
 
438 aa  200  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.44 
 
 
427 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3895  ring hydroxylating dioxygenase, Rieske (2Fe-2S) protein  31.51 
 
 
423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.9 
 
 
429 aa  192  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.88 
 
 
427 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0996141 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.88 
 
 
427 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1874  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.7 
 
 
436 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.61 
 
 
427 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.61 
 
 
427 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164916  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5079  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.91 
 
 
448 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.5 
 
 
440 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000409814  normal  0.0305498 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2496  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  32.07 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124288  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.64 
 
 
429 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.942727 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  32.07 
 
 
427 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.07 
 
 
427 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2105  putative (poly)aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit (Rieske (2Fe-2S) region)  31.72 
 
 
427 aa  179  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3814  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.45 
 
 
430 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.387965  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1493  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.56 
 
 
437 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.507919  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2679  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.54 
 
 
437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0890  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.91 
 
 
497 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145074  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3235  putative toluate 1,2-dioxygenase alpha subunit  29.38 
 
 
446 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4071  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.8 
 
 
429 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177236  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1343  Rieske (2Fe-2S) protein  28.71 
 
 
436 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0488  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  27.64 
 
 
455 aa  166  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2237  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  27.91 
 
 
458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0567  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  27.91 
 
 
458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5626  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.14 
 
 
458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0662  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  27.91 
 
 
455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0537  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.62 
 
 
466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689442  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0546  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.62 
 
 
466 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1668  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.39 
 
 
455 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779225  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.09 
 
 
455 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1642  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.39 
 
 
455 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1617  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.39 
 
 
455 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541424  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1660  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.37 
 
 
466 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1689  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.37 
 
 
466 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.550846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1716  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.37 
 
 
466 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77849  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2690  3-phenylpropionate dioxygenase alpha subunit  28.31 
 
 
453 aa  160  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.163483  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4415  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.05 
 
 
446 aa  160  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1130  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit-like protein  28.04 
 
 
453 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1139  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit-like protein  28.04 
 
 
453 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>