More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6299 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1591  Rieske (2Fe-2S) domain protein  86.06 
 
 
452 aa  844    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109039  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  87.17 
 
 
452 aa  842    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0496525  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  89.6 
 
 
452 aa  868    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.174297 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7046  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  94.47 
 
 
457 aa  909    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2634  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  66.51 
 
 
450 aa  645    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0538  Rieske (2Fe-2S) protein  69.02 
 
 
444 aa  659    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1306  Rieske (2Fe-2S) region  94.47 
 
 
452 aa  905    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6584  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  99.12 
 
 
452 aa  949    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208794  normal  0.710082 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6299  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
452 aa  954    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410726 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6524  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  94.47 
 
 
452 aa  905    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1177  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  80.09 
 
 
452 aa  784    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6131  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  94.03 
 
 
452 aa  903    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1364  Rieske (2Fe-2S) domain protein  87.83 
 
 
452 aa  852    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0122744  normal  0.102172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2368  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  64.37 
 
 
449 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4403  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  61.81 
 
 
465 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1134  ring hydroxylating dioxygenase alpha subunit  62.47 
 
 
462 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1324  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  62.79 
 
 
442 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0915  benzoate 1,2-dioxygenase subunit alpha BenA  62.61 
 
 
463 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08590  Benzoate-1,2-dioxygenase oxygenase component, alpha subunit  62.36 
 
 
453 aa  598  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5352  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  62.5 
 
 
455 aa  594  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587151 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4882  benzoate 1,2-dioxygenase subunit alpha  62.27 
 
 
464 aa  596  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3161  benzoate dioxygenase, alpha subunit  62.24 
 
 
452 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2688  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  61.38 
 
 
457 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2778  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  60.91 
 
 
446 aa  591  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.604479  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2112  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  61.12 
 
 
463 aa  593  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0473  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  61.8 
 
 
455 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.24 
 
 
452 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2719  benzoate 1,2-dioxygenase large subunit  60.23 
 
 
455 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602159  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2968  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  61.1 
 
 
452 aa  588  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1360  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  62.59 
 
 
455 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0187  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  62.59 
 
 
455 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3096  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  61.42 
 
 
444 aa  585  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1556  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  62.59 
 
 
455 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2581  benzoate 1,2 dioxygenase, alpha subunit  62.36 
 
 
455 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0215  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  62.59 
 
 
455 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2710  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  60.64 
 
 
452 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2725  benzoate 1,2 dioxygenase, alpha subunit  62.36 
 
 
455 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2321  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  61 
 
 
452 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32080  toluate 1,2-dioxygenase alpha subunit  59.95 
 
 
455 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1267  Rieske (2Fe-2S) region  59.45 
 
 
460 aa  573  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1391  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.31 
 
 
462 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109638  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1373  Rieske (2Fe-2S) region  58.31 
 
 
462 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1407  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.8 
 
 
462 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0632088  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.56 
 
 
456 aa  558  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141435  normal  0.0753315 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1297  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  59.82 
 
 
458 aa  557  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4158  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  58.49 
 
 
475 aa  531  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1761  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.03 
 
 
470 aa  459  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.104126 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.57 
 
 
492 aa  445  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32160  anthranilate dioxygenase large subunit  47.61 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243379  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2725  anthranilate 1,2-dioxygenase, large subunit  46.58 
 
 
464 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1680  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  37.59 
 
 
447 aa  324  3e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1758  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.59 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.16 
 
 
418 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.55 
 
 
443 aa  210  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37570  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  30.75 
 
 
424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.925134  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3556  p-cumate dioxygenase large subunit (CmtAb)  30.63 
 
 
434 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137255  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5382  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.63 
 
 
438 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2898  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.2 
 
 
434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1874  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.18 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3895  ring hydroxylating dioxygenase, Rieske (2Fe-2S) protein  30.6 
 
 
423 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.93 
 
 
427 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1531  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.14 
 
 
433 aa  192  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0185016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1493  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.31 
 
 
437 aa  190  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.507919  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2496  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  31.62 
 
 
427 aa  190  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124288  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.64 
 
 
427 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0996141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3192  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.09 
 
 
432 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.89 
 
 
427 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.89 
 
 
427 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.89 
 
 
427 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164916  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.63 
 
 
440 aa  189  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000409814  normal  0.0305498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.59 
 
 
429 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.75 
 
 
427 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5079  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.83 
 
 
448 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2679  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.75 
 
 
437 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  30.73 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2105  putative (poly)aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit (Rieske (2Fe-2S) region)  30.5 
 
 
427 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3814  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.79 
 
 
430 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.387965  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.71 
 
 
429 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.942727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3235  putative toluate 1,2-dioxygenase alpha subunit  31.47 
 
 
446 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0546  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.75 
 
 
466 aa  176  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0537  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.75 
 
 
466 aa  176  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689442  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1716  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.22 
 
 
466 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77849  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1660  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.22 
 
 
466 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1689  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.22 
 
 
466 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.550846  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3840  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.21 
 
 
450 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1343  Rieske (2Fe-2S) protein  31.27 
 
 
436 aa  170  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4415  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.11 
 
 
446 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0890  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.04 
 
 
497 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145074  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4071  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.35 
 
 
429 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177236  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4897  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.21 
 
 
435 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.227325  normal  0.4666 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5855  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  27.78 
 
 
447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0274508  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5458  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  27.78 
 
 
447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1995  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.79 
 
 
450 aa  163  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1690  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  27.51 
 
 
463 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1666  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  27.51 
 
 
463 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1639  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  27.51 
 
 
463 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.548645  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5639  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  27.51 
 
 
463 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726822  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0640  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  27.47 
 
 
463 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.409215  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0558  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  27.47 
 
 
463 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.559432  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0525  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  27.2 
 
 
463 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110269  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>