More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4588 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3667  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  98.35 
 
 
429 aa  877    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2563  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  89.18 
 
 
425 aa  801    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0203  ortho-halobenzoate 1,2-dioxygenase alpha-ISP protein OhbB  89.18 
 
 
425 aa  801    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0234  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  89.18 
 
 
425 aa  801    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0983  ortho-halobenzoate 1,2-dioxygenase alpha-ISP protein OhbB  89.18 
 
 
425 aa  801    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1575  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  89.18 
 
 
426 aa  801    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.417795  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2325  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  96.55 
 
 
435 aa  887    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0488  ortho-halobenzoate 1,2-dioxygenase alpha-ISP protein OhbB  89.88 
 
 
425 aa  804    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1108  anthranilate dioxygenase, large subunit (AndAc)  86.05 
 
 
423 aa  786    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803473  normal  0.183362 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3748  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  99.76 
 
 
423 aa  889    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171492  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1121  anthranilate dioxygenase, large subunit (AndAc)  86.29 
 
 
423 aa  788    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279249  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4588  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
435 aa  917    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.818031  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  98.39 
 
 
444 aa  902    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261439  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4957  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  95.86 
 
 
434 aa  874    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.55276  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
435 aa  917    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487989  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1378  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  89.18 
 
 
425 aa  801    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0616049  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2707  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  89.18 
 
 
425 aa  801    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1102  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  66.98 
 
 
420 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3868  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.99 
 
 
420 aa  442  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.555441  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1468  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.12 
 
 
413 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.2 
 
 
426 aa  393  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2752  putative terephthalate 1,2-dioxygenase, large subunit (TphA1)  47.73 
 
 
418 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3776  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  43.28 
 
 
429 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1107  ortho-halobenzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  46.58 
 
 
428 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4290  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.6 
 
 
435 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2348  putative aromatic dioxygenase, large subunit  42.79 
 
 
424 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4605  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.61 
 
 
439 aa  330  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4719  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  40.1 
 
 
417 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1090  putative salicylate-5-hydroxylase large oxygenase component oxidoreductase protein  39.01 
 
 
418 aa  309  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.580229  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3056  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.24 
 
 
420 aa  305  8.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.937037  normal  0.0275493 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2669  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.18 
 
 
418 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.612089  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0983  Rieske (2Fe-2S) region  39.4 
 
 
425 aa  296  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.472985  hitchhiker  0.000274154 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.9 
 
 
420 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423018  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0797  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.87 
 
 
419 aa  289  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5349  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38 
 
 
421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0165  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.5 
 
 
421 aa  286  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102384 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0941  putative Rieske-type ring dioxygenase alpha subunit  36.89 
 
 
414 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0896  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.24 
 
 
400 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394642  normal  0.258007 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.23 
 
 
393 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471832  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1646  Rieske (2Fe-2S) region  31.23 
 
 
393 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.23 
 
 
393 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.546967  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.23 
 
 
393 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.98 
 
 
429 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5630  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.98 
 
 
393 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0658  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.98 
 
 
393 aa  170  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0492  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.98 
 
 
393 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617282  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0563  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.98 
 
 
393 aa  170  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0538  Rieske (2Fe-2S) protein  32.58 
 
 
444 aa  160  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
418 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.73 
 
 
427 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.25 
 
 
427 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0996141 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0473  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  29.62 
 
 
455 aa  156  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  30.45 
 
 
427 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3835  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.41 
 
 
391 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45564  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2105  putative (poly)aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit (Rieske (2Fe-2S) region)  29.22 
 
 
427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.55 
 
 
452 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.174297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2496  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  29.66 
 
 
427 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124288  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.01 
 
 
427 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3814  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.95 
 
 
430 aa  152  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.387965  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.81 
 
 
427 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3895  ring hydroxylating dioxygenase, Rieske (2Fe-2S) protein  39.81 
 
 
423 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.81 
 
 
427 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164916  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2581  benzoate 1,2 dioxygenase, alpha subunit  29.06 
 
 
455 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2725  benzoate 1,2 dioxygenase, alpha subunit  29.06 
 
 
455 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6299  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.45 
 
 
452 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410726 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1177  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.07 
 
 
452 aa  152  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5079  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.81 
 
 
448 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6584  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.05 
 
 
452 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208794  normal  0.710082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.84 
 
 
429 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.942727 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0187  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  29.06 
 
 
455 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1556  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  29.06 
 
 
455 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0215  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  29.06 
 
 
455 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2368  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  29.72 
 
 
449 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1360  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  29.06 
 
 
455 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7046  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.29 
 
 
457 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3090  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.73 
 
 
186 aa  150  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2778  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  28.65 
 
 
446 aa  150  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.604479  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3192  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  36.82 
 
 
432 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1917  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.95 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4403  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  28.43 
 
 
465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1591  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.34 
 
 
452 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109039  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5352  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  40 
 
 
455 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1134  ring hydroxylating dioxygenase alpha subunit  28.92 
 
 
462 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1639  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  39.42 
 
 
463 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.548645  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0640  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  39.42 
 
 
463 aa  147  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.409215  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.48 
 
 
427 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4882  benzoate 1,2-dioxygenase subunit alpha  28.68 
 
 
464 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1666  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  39.42 
 
 
463 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5855  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  39.42 
 
 
447 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0274508  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1690  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  39.42 
 
 
463 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5458  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  39.42 
 
 
447 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0558  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  39.42 
 
 
463 aa  147  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.559432  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5639  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  39.42 
 
 
463 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726822  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.91 
 
 
443 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212221  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0525  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  39.42 
 
 
463 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110269  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08590  Benzoate-1,2-dioxygenase oxygenase component, alpha subunit  28.61 
 
 
453 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.37 
 
 
452 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0496525  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3096  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  27.98 
 
 
444 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1364  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.32 
 
 
452 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0122744  normal  0.102172 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6131  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.32 
 
 
452 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>