More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2253 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
406 aa  840    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  29.19 
 
 
387 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4213  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.05 
 
 
444 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.8 
 
 
423 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.54 
 
 
362 aa  153  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2464  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.61 
 
 
425 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31454  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.67 
 
 
421 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.2 
 
 
423 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478644  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.25 
 
 
362 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3376  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.3 
 
 
429 aa  149  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151153  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3683  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.63 
 
 
419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804885  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.69 
 
 
384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3715  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.9 
 
 
455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4357  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.03 
 
 
422 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.6 
 
 
429 aa  146  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.665588  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3717  Rieske (2Fe-2S) region  30.08 
 
 
425 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.126427  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3730  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.08 
 
 
425 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3790  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.08 
 
 
425 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.144005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3747  Rieske (2Fe-2S) region  37.44 
 
 
440 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00627634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3820  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.44 
 
 
440 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365881  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0324  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
442 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3702  Rieske (2Fe-2S) region  38.86 
 
 
455 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  26.44 
 
 
434 aa  144  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.86 
 
 
455 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1007  putative Rieske-type ring dioxygenase  27.14 
 
 
387 aa  143  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152396  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2328  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.34 
 
 
456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459675  normal  0.238108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3759  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.92 
 
 
440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0223979  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2260  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.19 
 
 
448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2261  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.2 
 
 
451 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3539  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.4 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3710  Rieske (2Fe-2S) region  39.07 
 
 
425 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3723  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.07 
 
 
425 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3783  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.07 
 
 
425 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0573009  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0763  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.56 
 
 
360 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4406  Rieske (2Fe-2S) region  34.12 
 
 
471 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2271  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.75 
 
 
443 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  0.774548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4787  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.12 
 
 
471 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.819616  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4493  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.12 
 
 
471 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.940392  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.86 
 
 
469 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1788  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.51 
 
 
470 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.07 
 
 
430 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.99 
 
 
449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.242613  normal  0.0404177 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  27.63 
 
 
393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0973  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.32 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0971663  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.98 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190649  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.39 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0198  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.75 
 
 
449 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2976  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.11 
 
 
419 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.01 
 
 
432 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3536  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.78 
 
 
444 aa  132  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6872  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.5 
 
 
452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4184  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.62 
 
 
423 aa  130  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2439  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.87 
 
 
449 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3695  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.23 
 
 
460 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036835  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  27.43 
 
 
373 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.46 
 
 
392 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0908  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.81 
 
 
441 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  25.92 
 
 
376 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0074  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.67 
 
 
396 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.35 
 
 
423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.252321  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  31.05 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.73 
 
 
376 aa  122  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5229  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.65 
 
 
390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6914  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.27 
 
 
431 aa  120  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3276  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.27 
 
 
436 aa  120  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1461  Rieske 2Fe-2S family protein  31.47 
 
 
405 aa  119  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.62 
 
 
398 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.24 
 
 
358 aa  119  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1416  Rieske 2Fe-2S family protein  31.03 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  27.88 
 
 
414 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2455  Rieske (2Fe-2S) protein  28.97 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3114  Rieske (2Fe-2S) region  28.57 
 
 
367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  24.78 
 
 
380 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.71 
 
 
447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102143  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1330  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.21 
 
 
369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  33.33 
 
 
382 aa  116  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4363  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.68 
 
 
487 aa  116  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000470921  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3895  ring hydroxylating dioxygenase, Rieske (2Fe-2S) protein  31.14 
 
 
423 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0890  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.05 
 
 
497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145074  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0966  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.23 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0374518  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  26.2 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3534  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.51 
 
 
473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  31.07 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  25.21 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.07 
 
 
374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1324  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  26.59 
 
 
442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3019  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.13 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.866348 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3505  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.78 
 
 
449 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231372  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4738  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.06 
 
 
377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.590157  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1758  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  27.79 
 
 
428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  31.07 
 
 
374 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.07 
 
 
374 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  31.07 
 
 
374 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3556  p-cumate dioxygenase large subunit (CmtAb)  27.87 
 
 
434 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137255  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1712  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.17 
 
 
415 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  23.31 
 
 
445 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1988  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.32 
 
 
470 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.07 
 
 
374 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.07 
 
 
374 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  31.07 
 
 
374 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>