More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3717 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.83 
 
 
423 aa  671    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478644  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  75.18 
 
 
423 aa  701    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190649  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  92.64 
 
 
421 aa  838    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2976  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  74.22 
 
 
419 aa  663    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2464  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  93.18 
 
 
425 aa  848    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31454  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3717  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
425 aa  894    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.126427  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3790  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
425 aa  894    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.144005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3730  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
425 aa  894    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  61.94 
 
 
423 aa  561  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3683  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  61 
 
 
419 aa  541  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804885  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.74 
 
 
429 aa  543  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.665588  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3376  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.07 
 
 
429 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151153  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4357  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.09 
 
 
422 aa  528  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4184  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.22 
 
 
423 aa  531  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  57.88 
 
 
430 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3710  Rieske (2Fe-2S) region  56.81 
 
 
425 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3723  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  56.81 
 
 
425 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3783  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  56.81 
 
 
425 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0573009  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4213  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  57.11 
 
 
444 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3747  Rieske (2Fe-2S) region  57.35 
 
 
440 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00627634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3820  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  57.35 
 
 
440 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365881  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3759  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  57.11 
 
 
440 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0223979  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2439  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  55.45 
 
 
449 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  71.59 
 
 
268 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6914  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.71 
 
 
431 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3276  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.71 
 
 
436 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0966  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.34 
 
 
397 aa  262  8.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0374518  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.71 
 
 
409 aa  252  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136632  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  33.49 
 
 
414 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0973  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.06 
 
 
396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0971663  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.08 
 
 
406 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3695  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.32 
 
 
460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3715  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.57 
 
 
455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.63 
 
 
362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4787  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.15 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.819616  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4406  Rieske (2Fe-2S) region  34.15 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4493  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.15 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.940392  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3702  Rieske (2Fe-2S) region  26.55 
 
 
455 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.55 
 
 
455 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.6 
 
 
362 aa  130  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.17 
 
 
469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2328  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.34 
 
 
456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459675  normal  0.238108 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.68 
 
 
423 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.23 
 
 
430 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.79 
 
 
447 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102143  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.85 
 
 
427 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  33.67 
 
 
374 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  36.08 
 
 
445 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  34.72 
 
 
430 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.22 
 
 
424 aa  124  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0911716  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.72 
 
 
430 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  33.81 
 
 
380 aa  123  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.78 
 
 
457 aa  123  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  34.02 
 
 
393 aa  123  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.94 
 
 
430 aa  122  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.16 
 
 
403 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.92 
 
 
430 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1788  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.72 
 
 
430 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.36 
 
 
432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  34.02 
 
 
432 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  32.22 
 
 
434 aa  120  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  32.64 
 
 
376 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_004310  BR1461  Rieske 2Fe-2S family protein  31.02 
 
 
405 aa  119  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1712  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.02 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1416  Rieske 2Fe-2S family protein  31.02 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0549  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.86 
 
 
414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.369608  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0401  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  33.51 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0142061  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1988  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.54 
 
 
470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  32.31 
 
 
429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4738  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.63 
 
 
377 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.590157  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2260  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.17 
 
 
448 aa  118  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6197  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  32.31 
 
 
429 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4815  Rieske (2Fe-2S) region  29.11 
 
 
413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0324  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.97 
 
 
442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.4 
 
 
423 aa  117  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.252321  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0597  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.86 
 
 
414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0052075  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.76 
 
 
449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.242613  normal  0.0404177 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6872  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.02 
 
 
452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3044  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.87 
 
 
369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332714 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.01 
 
 
426 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166676  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0835  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.38 
 
 
422 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0747  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.38 
 
 
422 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02037  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  29.27 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2115  iron-sulphur Rieske protein  28.38 
 
 
413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0578  Rieske (2Fe-2S) protein  30.2 
 
 
413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1861  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.38 
 
 
413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523473  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4897  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.92 
 
 
410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.71235 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.61 
 
 
413 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400487  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0981  ring hydroxylating dioxygenase alpha-subunit  33.33 
 
 
429 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.978274  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1680  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.16 
 
 
355 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  hitchhiker  0.000101719 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5015  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.61 
 
 
413 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277088  normal  0.658452 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4698  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.97 
 
 
377 aa  113  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.412068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0159  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.16 
 
 
340 aa  113  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0478  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.04 
 
 
413 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.04 
 
 
422 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0635134  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.04 
 
 
422 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.917605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0999  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.04 
 
 
422 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3553  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.2 
 
 
413 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.52 
 
 
414 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>