More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0908 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0908  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
441 aa  923    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0324  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.09 
 
 
442 aa  266  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6872  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.24 
 
 
452 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.63 
 
 
447 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102143  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4719  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.09 
 
 
447 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.32 
 
 
447 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0198  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.96 
 
 
449 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.72 
 
 
449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.242613  normal  0.0404177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3695  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.61 
 
 
460 aa  210  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036835  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2271  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.5 
 
 
443 aa  202  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  0.774548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2261  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
451 aa  193  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3546  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.16 
 
 
476 aa  193  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1788  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.36 
 
 
470 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4493  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.59 
 
 
471 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.940392  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.18 
 
 
457 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4787  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.59 
 
 
471 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.819616  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4406  Rieske (2Fe-2S) region  30.59 
 
 
471 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2260  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.03 
 
 
448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3484  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.9 
 
 
469 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3534  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.57 
 
 
473 aa  177  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3505  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.34 
 
 
449 aa  170  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231372  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3539  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.44 
 
 
448 aa  162  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3715  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.23 
 
 
455 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3702  Rieske (2Fe-2S) region  26 
 
 
455 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26 
 
 
455 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2328  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.12 
 
 
456 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459675  normal  0.238108 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3536  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.61 
 
 
444 aa  149  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.94 
 
 
469 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  35.71 
 
 
387 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1988  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.6 
 
 
470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.79 
 
 
362 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.81 
 
 
406 aa  124  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  29.71 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1007  putative Rieske-type ring dioxygenase  36.08 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152396  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3820  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.03 
 
 
440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365881  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3747  Rieske (2Fe-2S) region  34.03 
 
 
440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00627634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.82 
 
 
362 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4213  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.03 
 
 
444 aa  119  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.7 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.21 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.04 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3759  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.51 
 
 
440 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0223979  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1801  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.17 
 
 
401 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195025  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2455  Rieske (2Fe-2S) protein  34.39 
 
 
388 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  33.33 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4357  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.57 
 
 
422 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.95 
 
 
394 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.575491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2439  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.91 
 
 
449 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  33.8 
 
 
434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  32.81 
 
 
382 aa  113  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3276  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.83 
 
 
436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.51 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.665588  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6914  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.83 
 
 
431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2464  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.75 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31454  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0763  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.46 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.52 
 
 
398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.88 
 
 
383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3710  Rieske (2Fe-2S) region  31 
 
 
425 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3683  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.19 
 
 
419 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804885  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3783  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31 
 
 
425 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0573009  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3723  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31 
 
 
425 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3376  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.14 
 
 
429 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151153  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4363  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.16 
 
 
487 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000470921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.09 
 
 
423 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.36 
 
 
423 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190649  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0685  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.66 
 
 
484 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4897  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.3 
 
 
410 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.71235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0463  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.66 
 
 
484 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.328369  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.81 
 
 
384 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1531  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.79 
 
 
433 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0185016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  30.49 
 
 
380 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32 
 
 
430 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2685  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  30.7 
 
 
444 aa  107  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0595  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.16 
 
 
483 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1595  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.65 
 
 
483 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3730  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.02 
 
 
425 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.16 
 
 
409 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136632  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3790  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.02 
 
 
425 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.144005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1622  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.65 
 
 
484 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0299575  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.04 
 
 
385 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3717  Rieske (2Fe-2S) region  34.02 
 
 
425 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.126427  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2898  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.9 
 
 
434 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1647  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.65 
 
 
484 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  32.46 
 
 
374 aa  106  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  32.46 
 
 
374 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.46 
 
 
374 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4184  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.5 
 
 
423 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2976  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.66 
 
 
419 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  32.46 
 
 
374 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.46 
 
 
374 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.46 
 
 
374 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.29 
 
 
423 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.252321  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  32.46 
 
 
374 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.46 
 
 
374 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3556  p-cumate dioxygenase large subunit (CmtAb)  28.44 
 
 
434 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137255  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1995  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.03 
 
 
450 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.44 
 
 
432 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  29.58 
 
 
376 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  31.19 
 
 
427 aa  104  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1324  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  32.14 
 
 
442 aa  104  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0648485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>