More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0217 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0217  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  100 
 
 
437 aa  848    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.75 
 
 
353 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.94 
 
 
349 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  32.65 
 
 
349 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.19 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  45.79 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  38.05 
 
 
347 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.19 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  44.83 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  37.84 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.99 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  47.22 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.32 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.19 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.94 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4992  Rieske (2Fe-2S) region  34.17 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.32 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.32 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.64 
 
 
367 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.06 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2482  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.45 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  33.64 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41.94 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  39.2 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.07 
 
 
497 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2244  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.04 
 
 
332 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.937061  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2105  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  44.04 
 
 
332 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.886658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2050  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  44.04 
 
 
332 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.07 
 
 
497 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5800  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.91 
 
 
354 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
450 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  41.12 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40.74 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.48 
 
 
450 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3626  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.17 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  38.33 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  38.71 
 
 
492 aa  70.9  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.97 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  38.53 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0622  putative Rieske (2Fe-2S) protein  44.21 
 
 
314 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0948094 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2331  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.2 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1706  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.98 
 
 
225 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0736967  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.52 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.58 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  31.22 
 
 
436 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1303  Rieske (2Fe-2S) region  30.18 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.62 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.32 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174244  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2034  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.04 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.967449  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  41.24 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.67 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.592667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  37.5 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.67 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314282  normal  0.602397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  39.45 
 
 
351 aa  67  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.04 
 
 
352 aa  67  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 
406 aa  67  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  37.07 
 
 
347 aa  67  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  37.84 
 
 
348 aa  67  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  32.12 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3154  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.52 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.647374  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  32.19 
 
 
460 aa  66.6  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  33.11 
 
 
353 aa  66.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.61 
 
 
341 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2931  Pheophorbide a oxygenase  40.91 
 
 
477 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.71 
 
 
371 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0390  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39.82 
 
 
330 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1818  putative Rieske iron-sulfur protein  39.82 
 
 
330 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6662  dioxygenase, iron-sulfur subunit  38.71 
 
 
371 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364205  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2121  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.82 
 
 
330 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.25 
 
 
352 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1589  Rieske (2Fe-2S) region  38.71 
 
 
371 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  39.25 
 
 
352 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0488  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39.82 
 
 
330 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.386184  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6242  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.71 
 
 
371 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.25 
 
 
352 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  35.96 
 
 
499 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0864  cell death suppressor protein Lls1-like  60.78 
 
 
438 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  38.52 
 
 
359 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 
406 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2958  pheophorbide a oxygenase  34.15 
 
 
442 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0467803  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 
360 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.82 
 
 
330 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.169671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2122  putative iron-sulphur protein  39.82 
 
 
330 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  41.67 
 
 
369 aa  64.7  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  27.5 
 
 
358 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.78 
 
 
374 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3793  pheophorbide a oxygenase  29.82 
 
 
443 aa  64.3  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  34.19 
 
 
353 aa  64.3  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  36.67 
 
 
347 aa  63.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50613  Tic55 component of chloroplast import machinery  40.24 
 
 
498 aa  63.2  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  31.71 
 
 
366 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.12 
 
 
433 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  36.04 
 
 
367 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  34.55 
 
 
362 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  35.83 
 
 
369 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  33.33 
 
 
347 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35581  predicted protein  49.12 
 
 
386 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000902697  normal  0.474336 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  42.5 
 
 
668 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.48 
 
 
354 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>