126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6339 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6339  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
125 aa  262  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.515952 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2249  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.17 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4263  hypothetical protein  32.2 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.603078 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3222  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.02 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0490977  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3687  Rieske (2Fe-2S) region  31.53 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3760  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.53 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3700  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.53 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.58 
 
 
286 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.46 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.93 
 
 
518 aa  62.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.46 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4762  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.34 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1861  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.55 
 
 
105 aa  60.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.53 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  29.25 
 
 
291 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.63 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  32.54 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  31.4 
 
 
270 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2731  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.72 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20873  normal  0.962551 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.9 
 
 
309 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.06 
 
 
106 aa  52.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3443  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.72 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775174 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  30.68 
 
 
289 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.87 
 
 
101 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1739  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.44 
 
 
101 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  26.8 
 
 
103 aa  50.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  27.43 
 
 
289 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  27.55 
 
 
98 aa  50.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
289 aa  50.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0669  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  26.5 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.163122  normal  0.0446226 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1433  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  25.86 
 
 
604 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.26 
 
 
285 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2251  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.89 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.322428  normal  0.209318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.84 
 
 
594 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1967  Rieske (2Fe-2S) region  29.7 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0966264  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0534  Rieske (2Fe-2S) region  28.97 
 
 
123 aa  47.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1911  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.7 
 
 
100 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  21.82 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5508  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.41 
 
 
104 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1996  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.7 
 
 
100 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.664018  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0130  Rieske (2Fe-2S) protein  27.43 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.07 
 
 
367 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.75 
 
 
350 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.48 
 
 
374 aa  46.2  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000071782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5923  nitrite reductase (NAD(P)H)  29.89 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115962  normal  0.0766633 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  32.63 
 
 
334 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3441  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.41 
 
 
599 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  25.22 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0591  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  27.27 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2315  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.97 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.791717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3342  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.12 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139334  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.83 
 
 
105 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8366  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.32 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190915  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.03 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.05 
 
 
521 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.15 
 
 
301 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  34.15 
 
 
296 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.33 
 
 
549 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00870  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  21.85 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3120  pyruvate oxidase  25.53 
 
 
656 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.777401  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41540  assimilatory nitrite reductase small subunit  23.08 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0162  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.48 
 
 
98 aa  44.3  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.42 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  25 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468725  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3526  assimilatory nitrite reductase small subunit  23.08 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  24.32 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1987  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.84 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1780  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  25.21 
 
 
105 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.307476  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4335  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  27.07 
 
 
118 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  28.95 
 
 
356 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23360  assimilatory nitrite reductase, small subunit  23.93 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0534419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.45 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6713  putative ferredoxin  31.76 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491449  normal  0.188584 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6175  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.94 
 
 
593 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659991  hitchhiker  0.00257919 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0930  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.12 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3238  Rieske 2Fe-2S family protein  27.36 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5395  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.57 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5407  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  26.04 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347398  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3495  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.52 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.65589  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  35.71 
 
 
242 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40637  predicted protein  45 
 
 
510 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.59 
 
 
322 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.47 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1765  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.12 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.538609  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.16 
 
 
290 aa  42  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0225  Rieske 2Fe-2S family protein  24.35 
 
 
108 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0375984  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2308  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  26 
 
 
110 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619497  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3194  Rieske (2Fe-2S) region  25.77 
 
 
100 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.5117e-17  hitchhiker  4.2038099999999998e-22 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2354  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  26.97 
 
 
109 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0568758  normal  0.329857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  26.67 
 
 
102 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1995  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.94 
 
 
450 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3866  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.6 
 
 
108 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1335  Rieske (2Fe-2S) domain protein  20.61 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000656447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1307  Rieske (2Fe-2S) domain protein  20.61 
 
 
116 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.05 
 
 
509 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7008  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.43 
 
 
527 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144463  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3982  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.35 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0367029 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>