295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0162 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0162  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
98 aa  201  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  34.02 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  32.99 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  31.33 
 
 
242 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4115  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  42.37 
 
 
127 aa  58.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.063358  normal  0.0248701 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1861  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.63 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0225  Rieske 2Fe-2S family protein  36.59 
 
 
108 aa  57  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0375984  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3342  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.59 
 
 
131 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139334  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4231  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.84 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1911  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.58 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1967  Rieske (2Fe-2S) region  32.53 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0966264  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0173  Rieske (2Fe-2S) region  37.84 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0780  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.87 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.12357  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  34.88 
 
 
353 aa  55.1  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1996  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.58 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.664018  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7057  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.19 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250016  normal  0.403256 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.48 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  42.59 
 
 
345 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1468  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.7 
 
 
101 aa  53.5  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.74 
 
 
105 aa  53.5  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.87 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.31 
 
 
370 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4570  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.84 
 
 
105 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0919723  hitchhiker  0.000210645 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3044  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  38.36 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.109666  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4105  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.84 
 
 
105 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1338  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  37.84 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872244  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1305  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  37.84 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.935545  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.26 
 
 
101 aa  52  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.705451 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2492  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.84 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1503  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  37.84 
 
 
105 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0970  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  37.84 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0597  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  37.84 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0893389  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0321  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  37.84 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.23021  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.71 
 
 
406 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3982  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.84 
 
 
105 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0367029 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1232  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  37.84 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1987  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.92 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6323  Rieske (2Fe-2S) region  36.49 
 
 
101 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.84 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1103  Rieske (2Fe-2S) protein  37.84 
 
 
105 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476425  normal  0.326175 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  34.57 
 
 
353 aa  51.6  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3656  Rieske (2Fe-2S) region  37.84 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747877  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4711  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.84 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.938131  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.59 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  28.24 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3091  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.96 
 
 
104 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.954428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.18 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4992  Rieske (2Fe-2S) region  34.52 
 
 
366 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5657  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.67 
 
 
520 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302322  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  30.68 
 
 
238 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.65 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0188  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41.67 
 
 
548 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.56 
 
 
309 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1152  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.58 
 
 
521 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142651  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1649  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.3 
 
 
370 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1676  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.3 
 
 
349 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.945696  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1765  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.62 
 
 
112 aa  50.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.538609  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  37.14 
 
 
347 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0156  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  43.75 
 
 
525 aa  50.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  34.12 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.82 
 
 
373 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.592667 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.82 
 
 
373 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314282  normal  0.602397 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2796  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.73 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3175  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.44 
 
 
506 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759164  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.49 
 
 
406 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5407  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.45 
 
 
516 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1001  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  39.44 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5026  Rieske (2Fe-2S) region  45.45 
 
 
516 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.45 
 
 
516 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.363505  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  39.44 
 
 
599 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.76 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  37.14 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.63 
 
 
100 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.76 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.14 
 
 
289 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6713  putative ferredoxin  34.25 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491449  normal  0.188584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1004  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  33.78 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.749918 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3238  Rieske 2Fe-2S family protein  33.72 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2709  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.31 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3350  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.1 
 
 
106 aa  48.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40637  predicted protein  53.85 
 
 
510 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6662  dioxygenase, iron-sulfur subunit  34.33 
 
 
371 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364205  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0844  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.1 
 
 
106 aa  48.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.52 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0130  Rieske (2Fe-2S) protein  39.13 
 
 
106 aa  48.9  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2847  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.67 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.15292  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1589  Rieske (2Fe-2S) region  34.33 
 
 
371 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13852  hypothetical protein  44.68 
 
 
516 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6242  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.33 
 
 
371 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.33 
 
 
371 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2461  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.18 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.601158  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2675  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.47 
 
 
506 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148641  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0795  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.9 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.14 
 
 
289 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  35.48 
 
 
383 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.9 
 
 
549 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  27.85 
 
 
270 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.93 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1113  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  32.5 
 
 
120 aa  47.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.67 
 
 
353 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>