39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0188 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0156  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  70.99 
 
 		 525 aa  793    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0188  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  100 
 
 		 548 aa  1137    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13852  hypothetical protein  66.97 
 
 		 516 aa  736    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1152  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  67.64 
 
 		 521 aa  750    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142651  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5026  Rieske (2Fe-2S) region  67.58 
 
 		 516 aa  743    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276564  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5407  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  67.58 
 
 		 516 aa  742    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5657  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  67.4 
 
 		 520 aa  753    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302322  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  67.58 
 
 		 516 aa  743    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.363505  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.18 
 
 		 529 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1330  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.54 
 
 		 529 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2206  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.17 
 
 		 516 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0475184  normal  0.51009 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2842  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.33 
 
 		 526 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.57 
 
 		 549 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1515  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.89 
 
 		 469 aa  95.9  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0163  hypothetical protein  21.6 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000295747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.22 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08671  hypothetical protein  26.46 
 
 		 479 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0459434  unclonable  0.0000000643383 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0162  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.67 
 
 		 98 aa  50.8  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3515  hypothetical protein  25.2 
 
 		 434 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6475  beta-lactamase domain-containing protein  32.77 
 
 		 538 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.45 
 
 		 590 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  39.51 
 
 		 324 aa  47.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  39.51 
 
 		 423 aa  47  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  39.51 
 
 		 324 aa  47  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  52.5 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4325  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  42.31 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  38.27 
 
 		 324 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 324 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  38.27 
 
 		 324 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  38.27 
 
 		 324 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  37.04 
 
 		 324 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  38.27 
 
 		 324 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4115  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  39.66 
 
 		 127 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.063358  normal  0.0248701 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  37.04 
 
 		 324 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1349  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.9 
 
 		 95 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.203828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.22 
 
 		 326 aa  43.5  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  37.04 
 
 		 324 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 		 274 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  52.78 
 
 		 323 aa  43.5  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>