19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0116 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 		 481 aa  971    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.36 
 
 		 529 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1330  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.55 
 
 		 529 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2206  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.28 
 
 		 516 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0475184  normal  0.51009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1152  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.67 
 
 		 521 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142651  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5026  Rieske (2Fe-2S) region  24.08 
 
 		 516 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.08 
 
 		 516 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.363505  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5407  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.08 
 
 		 516 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13852  hypothetical protein  25.33 
 
 		 516 aa  101  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5657  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.57 
 
 		 520 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302322  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.61 
 
 		 549 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0156  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  25.24 
 
 		 525 aa  93.2  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2842  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.94 
 
 		 526 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0163  hypothetical protein  19.46 
 
 		 440 aa  87.4  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000295747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0188  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.22 
 
 		 548 aa  78.2  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1515  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.28 
 
 		 469 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08671  hypothetical protein  20 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0459434  unclonable  0.0000000643383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3422  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 		 535 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195853  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2796  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.73 
 
 		 108 aa  45.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>