34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1152 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0156  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  73.16 
 
 
525 aa  801    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0188  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  67.64 
 
 
548 aa  750    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13852  hypothetical protein  84.01 
 
 
516 aa  897    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1152  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
521 aa  1077    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142651  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5026  Rieske (2Fe-2S) region  88.08 
 
 
516 aa  953    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276564  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5407  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  88.27 
 
 
516 aa  955    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5657  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  90.77 
 
 
520 aa  986    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302322  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  88.08 
 
 
516 aa  953    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.363505  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1330  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.52 
 
 
529 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.52 
 
 
529 aa  519  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2206  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.48 
 
 
516 aa  511  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0475184  normal  0.51009 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2842  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.07 
 
 
526 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.99 
 
 
549 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.67 
 
 
481 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0163  hypothetical protein  23.09 
 
 
440 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000295747 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1515  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.68 
 
 
469 aa  83.6  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08671  hypothetical protein  25.67 
 
 
479 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0459434  unclonable  0.0000000643383 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0162  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.58 
 
 
98 aa  50.8  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6475  beta-lactamase domain-containing protein  30.25 
 
 
538 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  56.41 
 
 
323 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3515  hypothetical protein  31.88 
 
 
434 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  50 
 
 
431 aa  47.4  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  37.04 
 
 
324 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  37.04 
 
 
324 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  35.8 
 
 
324 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  37.04 
 
 
324 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  37.04 
 
 
423 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03775  putative hydrolase  24.4 
 
 
350 aa  45.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4325  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40 
 
 
369 aa  44.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  35.8 
 
 
324 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45 
 
 
449 aa  43.9  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  35.8 
 
 
324 aa  43.9  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  35.8 
 
 
324 aa  43.9  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  35.8 
 
 
324 aa  43.9  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>