236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03775 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03775  putative hydrolase  100 
 
 		 350 aa  737    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  37.22 
 
 		 303 aa  146  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  33.7 
 
 		 423 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  35.63 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  35.22 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  142  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  32.96 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  34.82 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  32.96 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  32.96 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  32.96 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  34.41 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.65 
 
 		 335 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 324 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  34.27 
 
 		 308 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.78 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  34.05 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  34.68 
 
 		 335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  37.39 
 
 		 364 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  33.21 
 
 		 362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  33.07 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  35 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  33.47 
 
 		 365 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  35.22 
 
 		 409 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  31.54 
 
 		 362 aa  123  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  33.46 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  29.7 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  30.59 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  35.47 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  33.47 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  31.31 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  31.48 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  32.88 
 
 		 358 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  34.82 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  31.3 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  31.3 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  32.16 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  34.21 
 
 		 342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  34.21 
 
 		 329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  34.21 
 
 		 342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  31.47 
 
 		 320 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  30.34 
 
 		 377 aa  116  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  32.1 
 
 		 375 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  30.43 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.09 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  30.43 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.63 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  32.92 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  30.12 
 
 		 320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.86 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  30.08 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  30.6 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  32.92 
 
 		 372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  34.09 
 
 		 336 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  33.62 
 
 		 372 aa  112  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  31.05 
 
 		 372 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.62 
 
 		 386 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  31.05 
 
 		 372 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  31.05 
 
 		 372 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  31.95 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  31.58 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  29.5 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5524  hypothetical protein  30.68 
 
 		 330 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608927  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  29.32 
 
 		 367 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  29.41 
 
 		 363 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  33.48 
 
 		 325 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.51 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  27.88 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  32.88 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  31.72 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  35.05 
 
 		 392 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  28.63 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  31.17 
 
 		 414 aa  105  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  31.78 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  30.63 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  31.62 
 
 		 361 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  30.22 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  28.14 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.07 
 
 		 419 aa  103  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  27.27 
 
 		 376 aa  102  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 		 363 aa  102  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  32.02 
 
 		 377 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  32.88 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.43 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  27.37 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  30.57 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  32.03 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  28.63 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  29.27 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  29.1 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.35 
 
 		 380 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  33.91 
 
 		 396 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  31.76 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.98 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>