296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10098 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  781    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  47.04 
 
 
320 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  47.04 
 
 
320 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  46.73 
 
 
320 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  45.79 
 
 
320 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  45.96 
 
 
320 aa  324  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  45.77 
 
 
320 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  45.77 
 
 
320 aa  322  6e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  39.89 
 
 
367 aa  300  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  39.84 
 
 
376 aa  293  4e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  43.02 
 
 
375 aa  291  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  41.69 
 
 
363 aa  290  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.22 
 
 
385 aa  289  7e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  41.19 
 
 
364 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2793  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40.69 
 
 
378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  38.61 
 
 
361 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  41.03 
 
 
374 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  39.95 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  40.12 
 
 
351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.51 
 
 
386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  36.6 
 
 
371 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  37.77 
 
 
369 aa  273  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  40.73 
 
 
358 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  40.91 
 
 
368 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  41.03 
 
 
362 aa  269  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  38.51 
 
 
350 aa  269  7e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  40.37 
 
 
362 aa  268  8e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  37.83 
 
 
367 aa  268  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40.46 
 
 
367 aa  266  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  38.89 
 
 
351 aa  265  8e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  39.82 
 
 
356 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  39.23 
 
 
360 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  37.53 
 
 
364 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  39.94 
 
 
356 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  40.67 
 
 
318 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.91 
 
 
374 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  34.23 
 
 
367 aa  263  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  39.76 
 
 
371 aa  262  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.76 
 
 
419 aa  261  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  38.66 
 
 
381 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  37.54 
 
 
363 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.09 
 
 
374 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  38.84 
 
 
376 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  41.57 
 
 
333 aa  260  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.91 
 
 
374 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  36.72 
 
 
377 aa  260  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  39.09 
 
 
374 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  40.62 
 
 
358 aa  260  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  36.78 
 
 
365 aa  259  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  40.33 
 
 
372 aa  259  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  39.09 
 
 
374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  39.09 
 
 
374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.58 
 
 
380 aa  259  6e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  37.24 
 
 
380 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  37.91 
 
 
372 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.11 
 
 
353 aa  256  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  36.31 
 
 
409 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  38.01 
 
 
366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  38.75 
 
 
363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  38.53 
 
 
376 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  38.11 
 
 
353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  38.59 
 
 
376 aa  252  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  37.2 
 
 
354 aa  252  8.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  37.46 
 
 
336 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  36.01 
 
 
363 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  36.01 
 
 
372 aa  248  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  37.16 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  37.16 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  37.16 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  37.35 
 
 
357 aa  242  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  37.24 
 
 
388 aa  238  9e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1097  Zn-dependent hydrolase  40.66 
 
 
366 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  35.31 
 
 
358 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  35.64 
 
 
361 aa  237  3e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3122  metallo-beta-lactamase family protein  39.87 
 
 
355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  33.79 
 
 
403 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  36.36 
 
 
392 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  36.8 
 
 
414 aa  226  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.65 
 
 
393 aa  222  9e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  40.89 
 
 
396 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  36.63 
 
 
320 aa  209  9e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  40.94 
 
 
320 aa  207  3e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  37.93 
 
 
332 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2463  outer membrane protein  52.55 
 
 
137 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717512  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  34.18 
 
 
329 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  34.18 
 
 
342 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  34.18 
 
 
342 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  33.33 
 
 
335 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  33.95 
 
 
356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  35.04 
 
 
324 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  35.04 
 
 
324 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  35.04 
 
 
324 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  35.44 
 
 
335 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  36 
 
 
335 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  34.16 
 
 
308 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  35.51 
 
 
324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  34.65 
 
 
324 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  34.25 
 
 
423 aa  152  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  35.47 
 
 
324 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.28 
 
 
325 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>