236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0936 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  100 
 
 
364 aa  747    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  62.18 
 
 
364 aa  464  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  51.98 
 
 
362 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  52.62 
 
 
358 aa  364  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  48.24 
 
 
376 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  50.46 
 
 
356 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  47.88 
 
 
368 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  48.52 
 
 
366 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  50 
 
 
363 aa  349  5e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  49.25 
 
 
350 aa  345  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  48.94 
 
 
367 aa  344  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  49.54 
 
 
357 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  48.63 
 
 
356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  48.63 
 
 
372 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  53.04 
 
 
369 aa  340  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  47.71 
 
 
374 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  47.4 
 
 
374 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  47.4 
 
 
374 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  47.38 
 
 
374 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  47.38 
 
 
374 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  46.77 
 
 
374 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  47.08 
 
 
376 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  51.17 
 
 
318 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  44.38 
 
 
380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  45.62 
 
 
362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  46.93 
 
 
381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  46.34 
 
 
376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  47.08 
 
 
374 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  43.85 
 
 
363 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  45.24 
 
 
363 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  45.28 
 
 
358 aa  311  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  46.8 
 
 
383 aa  309  5e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1097  Zn-dependent hydrolase  51.19 
 
 
366 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3122  metallo-beta-lactamase family protein  50.5 
 
 
355 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  41.19 
 
 
377 aa  287  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40.48 
 
 
385 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  44.11 
 
 
320 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  44.11 
 
 
320 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.72 
 
 
386 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  42.5 
 
 
320 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  44.09 
 
 
320 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  42.81 
 
 
320 aa  258  9e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  46.95 
 
 
320 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  40.68 
 
 
320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  38.65 
 
 
360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  36.16 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  44.15 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  38.7 
 
 
371 aa  252  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  38.67 
 
 
409 aa  249  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  40.62 
 
 
375 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  40.49 
 
 
351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  38.04 
 
 
367 aa  243  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  38.12 
 
 
372 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  38.12 
 
 
372 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  38.12 
 
 
372 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  37.04 
 
 
336 aa  238  9e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  41.54 
 
 
388 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.74 
 
 
419 aa  237  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  35.36 
 
 
376 aa  235  8e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  38.53 
 
 
354 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  38.53 
 
 
403 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.63 
 
 
353 aa  229  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  37.58 
 
 
333 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  38.49 
 
 
351 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  38.53 
 
 
353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  38.23 
 
 
358 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  37.39 
 
 
372 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.46 
 
 
380 aa  223  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  38.15 
 
 
361 aa  223  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  43.4 
 
 
372 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  37.75 
 
 
363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  40.21 
 
 
361 aa  219  6e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  37.69 
 
 
371 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.7 
 
 
393 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2793  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.86 
 
 
378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  39.66 
 
 
377 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.84 
 
 
367 aa  199  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  35.2 
 
 
396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  34.23 
 
 
414 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  35.84 
 
 
335 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  34.73 
 
 
392 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  41.63 
 
 
332 aa  185  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.69 
 
 
354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  36.22 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  39.27 
 
 
362 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  38.21 
 
 
325 aa  172  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  33.67 
 
 
320 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  33.67 
 
 
320 aa  170  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  35.51 
 
 
361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  39.47 
 
 
344 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  37.34 
 
 
308 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  38.84 
 
 
352 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  34.24 
 
 
329 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  39.13 
 
 
351 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  34.24 
 
 
342 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  33.23 
 
 
335 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  34.24 
 
 
342 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  35.98 
 
 
358 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  36.16 
 
 
331 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  39.57 
 
 
324 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>