229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0511 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  100 
 
 		 324 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  87.04 
 
 		 353 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  83.33 
 
 		 353 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  79.32 
 
 		 351 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  76.78 
 
 		 330 aa  511  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  55.69 
 
 		 329 aa  358  8e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  53.25 
 
 		 334 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  53.87 
 
 		 336 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  54.66 
 
 		 353 aa  343  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  54.04 
 
 		 353 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  52.01 
 
 		 337 aa  339  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  54.66 
 
 		 353 aa  334  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  53.56 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  54.97 
 
 		 353 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  54.97 
 
 		 353 aa  332  8e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  51.39 
 
 		 331 aa  329  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  54.21 
 
 		 352 aa  328  6e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  48.62 
 
 		 332 aa  306  3e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  48.47 
 
 		 332 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  51.39 
 
 		 328 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  48.14 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  45.96 
 
 		 358 aa  293  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  43.79 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  45.82 
 
 		 362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  45.54 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  45.42 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  45.94 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  44.73 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.82 
 
 		 354 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  42.61 
 
 		 335 aa  226  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  40.98 
 
 		 362 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  42.42 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  37.24 
 
 		 357 aa  186  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  35.76 
 
 		 324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  35.76 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  35.24 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  39.71 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  35.97 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  34.81 
 
 		 324 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  36.23 
 
 		 324 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  37 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  37 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  37 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  34.49 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  34.59 
 
 		 423 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  34.49 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  34.49 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  34.49 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  34.49 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  35.22 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  42.15 
 
 		 362 aa  168  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  39.02 
 
 		 356 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  38.1 
 
 		 372 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  38.1 
 
 		 372 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  40.79 
 
 		 376 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  39.36 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  38.1 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  37.64 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  36.94 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.66 
 
 		 335 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  39.57 
 
 		 364 aa  159  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  38.35 
 
 		 372 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  39.38 
 
 		 358 aa  159  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  36.58 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  38.63 
 
 		 371 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  35.38 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  37.25 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  34.87 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2793  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.04 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  35.38 
 
 		 388 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  38.37 
 
 		 367 aa  149  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  36.51 
 
 		 383 aa  149  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.03 
 
 		 385 aa  149  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.77 
 
 		 386 aa  149  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  36.03 
 
 		 336 aa  148  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  39.48 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.87 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  35.69 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  37.16 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  37.72 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  34.63 
 
 		 372 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  38.02 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  36.61 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  33.87 
 
 		 371 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5524  hypothetical protein  32.12 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608927  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  35.42 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  37.77 
 
 		 377 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.29 
 
 		 367 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  36.08 
 
 		 351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  33.33 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  32.84 
 
 		 376 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  38.64 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03132  Zn-dependent hydrolase/oxidoreductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13010)  31.07 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.131518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  34.44 
 
 		 363 aa  139  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.91 
 
 		 374 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  35.96 
 
 		 363 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.14 
 
 		 374 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0514  outer membrane protein  33.33 
 
 		 398 aa  136  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  35.06 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  34.12 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>