260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10924 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  744    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  64.78 
 
 
372 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  64.78 
 
 
372 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  64.78 
 
 
372 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  63.34 
 
 
371 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  62.9 
 
 
372 aa  477  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  58.4 
 
 
409 aa  388  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  55.43 
 
 
353 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  53.87 
 
 
365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  51.5 
 
 
367 aa  352  5e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  54.49 
 
 
371 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  52.92 
 
 
396 aa  344  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  53.5 
 
 
360 aa  342  7e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  50.13 
 
 
386 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  50.56 
 
 
385 aa  332  6e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  50.13 
 
 
393 aa  322  4e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  48.18 
 
 
403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  49.83 
 
 
388 aa  272  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  43.81 
 
 
336 aa  269  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  45.78 
 
 
358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  44.26 
 
 
369 aa  259  7e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  43.71 
 
 
380 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  42.86 
 
 
376 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.28 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  42.41 
 
 
363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  41.96 
 
 
381 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  42.82 
 
 
374 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  42.99 
 
 
374 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  42.99 
 
 
374 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  42.99 
 
 
374 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  40.17 
 
 
357 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  40.51 
 
 
375 aa  249  8e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  44.82 
 
 
366 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  41.86 
 
 
374 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  45.12 
 
 
358 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  42.48 
 
 
350 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  36.01 
 
 
377 aa  248  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  37.78 
 
 
376 aa  247  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  43.28 
 
 
374 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  42.02 
 
 
362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  44.07 
 
 
363 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  49.81 
 
 
362 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  42.27 
 
 
376 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  40 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  41.64 
 
 
358 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  42.72 
 
 
368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2793  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.08 
 
 
378 aa  242  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  38.97 
 
 
351 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  38.34 
 
 
363 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  39.75 
 
 
351 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  42.27 
 
 
318 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  38.07 
 
 
376 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  41.97 
 
 
372 aa  237  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  41.31 
 
 
356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  41.27 
 
 
356 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  40.94 
 
 
320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3122  metallo-beta-lactamase family protein  44.09 
 
 
355 aa  232  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1097  Zn-dependent hydrolase  41.54 
 
 
366 aa  232  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  41.49 
 
 
363 aa  232  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  37.61 
 
 
364 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  37.91 
 
 
367 aa  230  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  38.85 
 
 
361 aa  229  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  36.47 
 
 
333 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  37.39 
 
 
364 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  39.86 
 
 
320 aa  222  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  38.77 
 
 
320 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  38.77 
 
 
320 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  39.49 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  37.87 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  38.64 
 
 
320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  36.44 
 
 
367 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  37.31 
 
 
361 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.89 
 
 
380 aa  214  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.17 
 
 
419 aa  207  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.04 
 
 
367 aa  206  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  33.23 
 
 
353 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  32.84 
 
 
354 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  33.63 
 
 
377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  37.88 
 
 
414 aa  193  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  33.82 
 
 
392 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  41.92 
 
 
332 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  32.29 
 
 
320 aa  186  8e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  31.33 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.26 
 
 
354 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  37.25 
 
 
342 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  37.25 
 
 
342 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  37.25 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.57 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  34.95 
 
 
351 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  38.73 
 
 
344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  34.38 
 
 
335 aa  167  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  40.16 
 
 
362 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  36.52 
 
 
329 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  41.22 
 
 
335 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  41.13 
 
 
357 aa  160  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  41.46 
 
 
303 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.86 
 
 
335 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  38.55 
 
 
356 aa  156  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  34.59 
 
 
361 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  39.75 
 
 
344 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>