254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2793 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2793  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  100 
 
 		 378 aa  783    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  57.35 
 
 		 367 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  49.6 
 
 		 380 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  50 
 
 		 376 aa  373  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  48.92 
 
 		 377 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  49.58 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  45.43 
 
 		 367 aa  352  4e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  48.73 
 
 		 363 aa  346  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  50.15 
 
 		 333 aa  343  4e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  44.38 
 
 		 354 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  45.06 
 
 		 353 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  40.69 
 
 		 377 aa  291  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.08 
 
 		 385 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  39.1 
 
 		 336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  43.58 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.37 
 
 		 386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  41.64 
 
 		 351 aa  249  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  39.07 
 
 		 362 aa  249  5e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  37.96 
 
 		 409 aa  249  6e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  37.08 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  40.66 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  38.04 
 
 		 375 aa  246  6e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  36.01 
 
 		 358 aa  246  6.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  37.72 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  37.69 
 
 		 372 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  37.69 
 
 		 372 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  37.69 
 
 		 372 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  35.52 
 
 		 360 aa  240  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  41.7 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  36.16 
 
 		 361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  38.79 
 
 		 372 aa  235  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  37.39 
 
 		 371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  41.2 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  41.2 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  35.23 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  34.67 
 
 		 358 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  40.07 
 
 		 320 aa  230  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  38.82 
 
 		 320 aa  229  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  37.58 
 
 		 363 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  40.07 
 
 		 320 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  40.07 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  37.5 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  36.5 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  37.43 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  35.37 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  36.23 
 
 		 367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  34.68 
 
 		 403 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  37.2 
 
 		 362 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  34.83 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  34.83 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.24 
 
 		 419 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  34.77 
 
 		 376 aa  223  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.83 
 
 		 374 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  37.93 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  34.86 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.67 
 
 		 374 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  36.68 
 
 		 358 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  35.91 
 
 		 374 aa  219  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  35.91 
 
 		 364 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  36.86 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  37.95 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  34.55 
 
 		 374 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.06 
 
 		 374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  36.25 
 
 		 376 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  36.25 
 
 		 376 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  35.28 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  39.04 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  36.75 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  34.2 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  35.87 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1097  Zn-dependent hydrolase  39.2 
 
 		 366 aa  209  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.29 
 
 		 353 aa  209  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  35.26 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  34.8 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  34.56 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3122  metallo-beta-lactamase family protein  38.96 
 
 		 355 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  35.94 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.56 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  36.67 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  33.04 
 
 		 392 aa  192  8e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  32.44 
 
 		 414 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  36.84 
 
 		 396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  35.34 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  38.83 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  40.61 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  38.68 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  39.09 
 
 		 353 aa  157  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  33.97 
 
 		 353 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  36.47 
 
 		 353 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  39.48 
 
 		 353 aa  155  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  31.01 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  37.07 
 
 		 330 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.33 
 
 		 354 aa  145  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  34.12 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  31.72 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  34.16 
 
 		 335 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 		 352 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  33.06 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2463  outer membrane protein  44.36 
 
 		 137 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>