263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1463 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  789    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  53.4 
 
 
357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  55.03 
 
 
366 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  51.02 
 
 
358 aa  391  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  50.87 
 
 
362 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  52.83 
 
 
363 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  49.71 
 
 
368 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  52.07 
 
 
374 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  53.75 
 
 
381 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  51.88 
 
 
380 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  52.5 
 
 
376 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  51.82 
 
 
374 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  50.61 
 
 
374 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1097  Zn-dependent hydrolase  55.21 
 
 
366 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  52.01 
 
 
374 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  51.68 
 
 
376 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  52.32 
 
 
374 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  52.01 
 
 
374 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  52.01 
 
 
374 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  50.91 
 
 
363 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  46.22 
 
 
363 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  50.63 
 
 
350 aa  359  5e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3122  metallo-beta-lactamase family protein  53.57 
 
 
355 aa  341  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  46.29 
 
 
372 aa  331  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  51.24 
 
 
369 aa  328  7e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  45.56 
 
 
367 aa  328  7e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  47.15 
 
 
356 aa  326  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  46.25 
 
 
356 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  49.83 
 
 
318 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  51.04 
 
 
362 aa  311  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  46.8 
 
 
364 aa  309  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  44.66 
 
 
364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  44.41 
 
 
358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  46.6 
 
 
376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  39.95 
 
 
377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40.61 
 
 
385 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.26 
 
 
386 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  38.58 
 
 
360 aa  256  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  40.36 
 
 
372 aa  255  8e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  40.36 
 
 
372 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  40.36 
 
 
372 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  40.55 
 
 
336 aa  253  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  39.75 
 
 
351 aa  250  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40.48 
 
 
367 aa  247  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  45.04 
 
 
320 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  45.04 
 
 
320 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  42.66 
 
 
367 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  40.36 
 
 
358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  40 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.34 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  41.9 
 
 
320 aa  243  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  37.85 
 
 
371 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  39.64 
 
 
372 aa  242  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  40.8 
 
 
363 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  39.01 
 
 
361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  41.5 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  43.75 
 
 
320 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  37.8 
 
 
371 aa  239  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  40.7 
 
 
409 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  40 
 
 
320 aa  237  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  41.7 
 
 
365 aa  235  8e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  37.58 
 
 
375 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  43.8 
 
 
351 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  37.04 
 
 
376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  38.61 
 
 
320 aa  232  9e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  39.93 
 
 
388 aa  230  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  42.28 
 
 
377 aa  229  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  37.88 
 
 
403 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  37.72 
 
 
354 aa  227  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  38.27 
 
 
367 aa  226  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  39.08 
 
 
353 aa  222  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  38.48 
 
 
396 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  37.31 
 
 
333 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40.61 
 
 
393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.7 
 
 
419 aa  216  5e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2793  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.6 
 
 
378 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40.4 
 
 
380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  38.36 
 
 
320 aa  206  8e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  38.6 
 
 
361 aa  204  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  39.53 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  36.66 
 
 
392 aa  199  9e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  37.95 
 
 
332 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  37.95 
 
 
414 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.22 
 
 
354 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  39.38 
 
 
335 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  33.93 
 
 
342 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  33.93 
 
 
342 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  34.59 
 
 
329 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  39.33 
 
 
325 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  33.65 
 
 
361 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  37.97 
 
 
356 aa  162  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.04 
 
 
325 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  34.96 
 
 
361 aa  160  5e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  33.02 
 
 
362 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  36.6 
 
 
353 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  37.89 
 
 
351 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  36.03 
 
 
308 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  35.63 
 
 
335 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  36.84 
 
 
324 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  36.4 
 
 
324 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>