272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3122 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3122  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 355 aa  724    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  73.22 
 
 		 368 aa  541  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1097  Zn-dependent hydrolase  78.66 
 
 		 366 aa  512  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  62.74 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  65.54 
 
 		 363 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  59.38 
 
 		 366 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  57.55 
 
 		 374 aa  401  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  57.64 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  57.01 
 
 		 374 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  57.05 
 
 		 374 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  57.01 
 
 		 374 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  57.05 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  58.2 
 
 		 381 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  59.67 
 
 		 358 aa  388  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  60.13 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  58.11 
 
 		 376 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  54.43 
 
 		 374 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  54.25 
 
 		 380 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  60.88 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  58.28 
 
 		 362 aa  378  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  58.9 
 
 		 363 aa  378  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  51.59 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  53.57 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  51.85 
 
 		 369 aa  346  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  49.83 
 
 		 356 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  49.33 
 
 		 356 aa  323  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  49.5 
 
 		 372 aa  322  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  47.62 
 
 		 362 aa  322  6e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  50.71 
 
 		 376 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  52.86 
 
 		 318 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  50.5 
 
 		 364 aa  319  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  46.63 
 
 		 358 aa  318  7e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  49.5 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  49.83 
 
 		 367 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  48.01 
 
 		 371 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  39.87 
 
 		 377 aa  259  4e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  43.93 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  44.88 
 
 		 372 aa  257  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  44.95 
 
 		 372 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  44.95 
 
 		 372 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  44.95 
 
 		 372 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  42.86 
 
 		 385 aa  255  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.05 
 
 		 386 aa  252  9.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  45.49 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  40.14 
 
 		 320 aa  249  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  40.07 
 
 		 320 aa  248  9e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  39.3 
 
 		 351 aa  248  9e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  40.07 
 
 		 320 aa  248  9e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  39.6 
 
 		 320 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  39.46 
 
 		 320 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  44.57 
 
 		 365 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  39.26 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  41.81 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  46.44 
 
 		 353 aa  242  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  45.52 
 
 		 393 aa  242  9e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  42.14 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  41.96 
 
 		 336 aa  239  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  42.35 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  41.64 
 
 		 372 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  37.63 
 
 		 320 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  38.44 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  44.77 
 
 		 358 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  41.3 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  42.25 
 
 		 363 aa  230  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  44.66 
 
 		 409 aa  226  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  37.27 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  40.85 
 
 		 361 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2793  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.96 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  38.06 
 
 		 333 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.61 
 
 		 419 aa  211  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  42.14 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.28 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.16 
 
 		 367 aa  210  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  38.6 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  38.6 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  37.16 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  40.75 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  36.18 
 
 		 354 aa  202  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  35.84 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  39.34 
 
 		 361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  36.47 
 
 		 332 aa  192  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  35.18 
 
 		 392 aa  189  8e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  39.33 
 
 		 414 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.45 
 
 		 354 aa  182  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  38.43 
 
 		 335 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  35.37 
 
 		 335 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  36.55 
 
 		 342 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  36.55 
 
 		 342 aa  162  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  36.55 
 
 		 329 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  39.83 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  38.11 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  36.63 
 
 		 362 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  39.92 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.78 
 
 		 325 aa  158  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  36.96 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  35.06 
 
 		 324 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  36.95 
 
 		 362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  41.1 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  35.8 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  37 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>