203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1210 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  730    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  50.92 
 
 		 331 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  49.69 
 
 		 334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  48.43 
 
 		 351 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  50.15 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  47.71 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  46.6 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  47.06 
 
 		 330 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  45.96 
 
 		 324 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  47.52 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  48.17 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  48.61 
 
 		 344 aa  288  9e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  47.94 
 
 		 328 aa  286  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  45.96 
 
 		 353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  44.73 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  46.32 
 
 		 332 aa  280  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  44.44 
 
 		 353 aa  280  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  46.32 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  45.4 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  46.01 
 
 		 353 aa  275  7e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  46.98 
 
 		 352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  43.84 
 
 		 336 aa  273  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  44.83 
 
 		 353 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  44.19 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  43.31 
 
 		 362 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  44.03 
 
 		 325 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.43 
 
 		 354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  41.14 
 
 		 335 aa  242  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.57 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  38.62 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  41.05 
 
 		 362 aa  195  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  34.95 
 
 		 332 aa  184  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  38.78 
 
 		 357 aa  170  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  35.61 
 
 		 423 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  33.02 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  34.89 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  34.53 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  35.51 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  34.91 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  34.89 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.1 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  34.89 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  34.17 
 
 		 324 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  34.17 
 
 		 324 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  34.17 
 
 		 324 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  36.24 
 
 		 303 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  34.17 
 
 		 324 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0514  outer membrane protein  34.91 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  36.84 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  35.98 
 
 		 364 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  35.04 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  36.6 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  36.15 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  37.23 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  37.23 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  37.23 
 
 		 372 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  37.2 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  36.15 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  36.15 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.59 
 
 		 385 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.24 
 
 		 374 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  34.3 
 
 		 357 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.61 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.24 
 
 		 374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  31.84 
 
 		 367 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  36.3 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  36.3 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  36.82 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.3 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  32.49 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03132  Zn-dependent hydrolase/oxidoreductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13010)  29.17 
 
 		 414 aa  150  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.131518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  38.37 
 
 		 372 aa  150  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  36.9 
 
 		 409 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  35.5 
 
 		 372 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.83 
 
 		 386 aa  149  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  31.02 
 
 		 383 aa  149  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  36.65 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  30.74 
 
 		 308 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.86 
 
 		 393 aa  146  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  34.93 
 
 		 358 aa  146  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  33 
 
 		 365 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  36.05 
 
 		 388 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  32.83 
 
 		 380 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  39.56 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  30.28 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  35.98 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  42.16 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  35.42 
 
 		 376 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  33.85 
 
 		 377 aa  143  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  38.16 
 
 		 371 aa  143  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  37.4 
 
 		 366 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  32.74 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  35.5 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  36.11 
 
 		 376 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  34.31 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  41.18 
 
 		 381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  34.94 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_006686  CND01370  conserved hypothetical protein  31.21 
 
 		 361 aa  139  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  31.87 
 
 		 369 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  34 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>