More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2646 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  694    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  77.89 
 
 
308 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  55.63 
 
 
423 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  55.96 
 
 
324 aa  368  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  54.69 
 
 
324 aa  368  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  54.69 
 
 
324 aa  368  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  55.96 
 
 
324 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  55.12 
 
 
324 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  55.12 
 
 
324 aa  364  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  55.12 
 
 
324 aa  364  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  55.12 
 
 
324 aa  364  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  53.02 
 
 
324 aa  361  8e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  54.04 
 
 
324 aa  359  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  40.67 
 
 
303 aa  223  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  43.19 
 
 
335 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  49.31 
 
 
335 aa  208  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.19 
 
 
354 aa  208  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  41.67 
 
 
296 aa  203  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  37.7 
 
 
332 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  32.59 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  34.56 
 
 
362 aa  189  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  33.76 
 
 
342 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  33.76 
 
 
329 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  33.76 
 
 
342 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  39.92 
 
 
356 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  40.15 
 
 
325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  36.66 
 
 
361 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.05 
 
 
325 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1825  outer membrane protein  31.99 
 
 
362 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  36.31 
 
 
328 aa  172  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  38.25 
 
 
348 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  35.22 
 
 
324 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  34.38 
 
 
330 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  34.52 
 
 
362 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  35.56 
 
 
351 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  38.22 
 
 
336 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  33.12 
 
 
332 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  35.82 
 
 
331 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  33.23 
 
 
332 aa  166  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  34.49 
 
 
353 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  36.98 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  37.31 
 
 
353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  33.33 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0514  outer membrane protein  36.4 
 
 
398 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  35.88 
 
 
368 aa  162  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.28 
 
 
374 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  36.13 
 
 
344 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  36.26 
 
 
362 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.5 
 
 
374 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  35.62 
 
 
358 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5524  hypothetical protein  37.6 
 
 
330 aa  159  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608927  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  34.55 
 
 
344 aa  159  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  31.51 
 
 
334 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.79 
 
 
385 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.55 
 
 
374 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 
353 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  37.55 
 
 
374 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  37.55 
 
 
374 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  35.91 
 
 
357 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  35.27 
 
 
330 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  38.4 
 
 
374 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  32.7 
 
 
337 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  37.5 
 
 
358 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.71 
 
 
590 aa  152  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  32.14 
 
 
364 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  33.33 
 
 
353 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  36.06 
 
 
366 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  33.45 
 
 
351 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  32.49 
 
 
358 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  33.45 
 
 
336 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  37.07 
 
 
363 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  34.69 
 
 
388 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  34.85 
 
 
364 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.77 
 
 
386 aa  149  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  33.33 
 
 
361 aa  149  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  33 
 
 
353 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  33.21 
 
 
376 aa  149  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  35.45 
 
 
362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  36.29 
 
 
367 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  37.5 
 
 
363 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  30.14 
 
 
320 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  33.59 
 
 
369 aa  146  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  30.71 
 
 
320 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  30.86 
 
 
320 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  30.86 
 
 
320 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  30.86 
 
 
320 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  31.88 
 
 
329 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  35.5 
 
 
381 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  36.36 
 
 
380 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  36.3 
 
 
360 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  32.99 
 
 
336 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  32.08 
 
 
353 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  30.74 
 
 
320 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  31.16 
 
 
375 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 
353 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  38.24 
 
 
372 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  38.24 
 
 
372 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  32.99 
 
 
371 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  38.24 
 
 
372 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  35.75 
 
 
351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>