185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0514 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0514  outer membrane protein  100 
 
 
398 aa  818    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1825  outer membrane protein  34.06 
 
 
362 aa  222  9e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  39.44 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  34.52 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  36.47 
 
 
356 aa  176  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  39.06 
 
 
332 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  40.54 
 
 
335 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  38.11 
 
 
362 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  38.04 
 
 
324 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.5 
 
 
354 aa  169  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  36.19 
 
 
324 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  37.02 
 
 
324 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  38.17 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.54 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  36.26 
 
 
324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  36.26 
 
 
324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  36.26 
 
 
324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  37.4 
 
 
324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  36.4 
 
 
335 aa  163  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  36.33 
 
 
325 aa  162  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  36.26 
 
 
324 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  35.5 
 
 
423 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  34.91 
 
 
358 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  35.56 
 
 
344 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  35.25 
 
 
376 aa  159  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  36.08 
 
 
324 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.77 
 
 
335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  34.67 
 
 
332 aa  155  9e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  33.82 
 
 
342 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  33.82 
 
 
342 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  39.29 
 
 
362 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  33.82 
 
 
329 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  32.72 
 
 
331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  34.47 
 
 
332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  37.6 
 
 
362 aa  154  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  30.42 
 
 
348 aa  153  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.99 
 
 
374 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  32.72 
 
 
328 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.49 
 
 
374 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.53 
 
 
374 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  38.49 
 
 
374 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  38.49 
 
 
374 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  30.33 
 
 
376 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  33.64 
 
 
362 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  36.86 
 
 
376 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  35.05 
 
 
350 aa  150  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  34.63 
 
 
363 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  37.61 
 
 
374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  34.28 
 
 
361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  34.29 
 
 
358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  38.22 
 
 
363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5524  hypothetical protein  30.46 
 
 
330 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608927  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  33.45 
 
 
366 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  35.18 
 
 
357 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  37.56 
 
 
356 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  36.65 
 
 
376 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  30.57 
 
 
335 aa  143  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  33.1 
 
 
356 aa  143  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 
367 aa  143  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  31.82 
 
 
381 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  32.29 
 
 
336 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  33.1 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  37.22 
 
 
380 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  32.7 
 
 
336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  30.65 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  37.33 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  34.57 
 
 
367 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  37.1 
 
 
363 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  37.1 
 
 
318 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 
329 aa  139  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
353 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  37.55 
 
 
358 aa  139  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  32.42 
 
 
353 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  31.69 
 
 
334 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  36.2 
 
 
374 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  34.32 
 
 
361 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 
352 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  34.55 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  35.84 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  32.12 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  31.37 
 
 
353 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  28.8 
 
 
364 aa  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  33.33 
 
 
351 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  34.23 
 
 
351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  34.09 
 
 
336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  33.33 
 
 
324 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.08 
 
 
353 aa  136  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38719  predicted protein  33.83 
 
 
457 aa  136  8e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248337  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  35.47 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  33.83 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 
353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  37.29 
 
 
372 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  37.29 
 
 
372 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  33.08 
 
 
351 aa  133  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  35.43 
 
 
377 aa  132  9e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  30.31 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  37.84 
 
 
358 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  36.86 
 
 
372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  36.4 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  31.87 
 
 
372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>