228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1801 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 330 aa  665    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  56.92 
 
 		 328 aa  371  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  57.72 
 
 		 353 aa  363  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  56 
 
 		 353 aa  361  9e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  57.72 
 
 		 353 aa  359  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  56.92 
 
 		 353 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  55.38 
 
 		 353 aa  354  8.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  53.5 
 
 		 334 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  57.14 
 
 		 352 aa  348  7e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  54.6 
 
 		 353 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  53.52 
 
 		 329 aa  347  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  52.58 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  54.29 
 
 		 353 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  53.58 
 
 		 351 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  53.96 
 
 		 337 aa  335  7e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  53.56 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  52.81 
 
 		 332 aa  329  4e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  52.34 
 
 		 332 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  51.53 
 
 		 330 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  53.05 
 
 		 331 aa  323  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  47.52 
 
 		 358 aa  291  9e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  47.35 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  44.01 
 
 		 362 aa  258  8e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  47.52 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  45.81 
 
 		 325 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  42.6 
 
 		 361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  40.51 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  42.62 
 
 		 354 aa  241  9e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  41.22 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  42.2 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  42.49 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  37.79 
 
 		 362 aa  192  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  37.87 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  36.34 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  36.34 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  36.34 
 
 		 329 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03132  Zn-dependent hydrolase/oxidoreductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13010)  35.45 
 
 		 414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.131518 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  35.02 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  35.8 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  34.34 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  34.34 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  33.89 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  35.35 
 
 		 324 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  33.67 
 
 		 324 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  33.67 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  33.67 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  33.67 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 		 324 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  34.68 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  35.66 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  34.81 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  35.27 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  33.77 
 
 		 365 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.83 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  35.69 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  35.79 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  38.22 
 
 		 335 aa  146  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  34.63 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  37.63 
 
 		 388 aa  143  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  32.34 
 
 		 362 aa  142  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.42 
 
 		 353 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  34.01 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  36.12 
 
 		 358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38719  predicted protein  31.71 
 
 		 457 aa  139  7e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  33.92 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  33.92 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  33.92 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  35.4 
 
 		 364 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.11 
 
 		 386 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5524  hypothetical protein  32.33 
 
 		 330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608927  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  35.47 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  34.84 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  34.73 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.75 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  30.63 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.59 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  33.59 
 
 		 371 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0514  outer membrane protein  30.31 
 
 		 398 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04610  conserved hypothetical protein  33.2 
 
 		 434 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  35.63 
 
 		 372 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  34.15 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  32.81 
 
 		 396 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  29.38 
 
 		 364 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01370  conserved hypothetical protein  28.39 
 
 		 361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  33.48 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  33.19 
 
 		 351 aa  125  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  34.22 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2793  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.25 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  31.38 
 
 		 374 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  29.18 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  32.51 
 
 		 371 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  28.08 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  28.08 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  33.33 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  31.64 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  33.85 
 
 		 376 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  31.38 
 
 		 380 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  31.45 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>