228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_38719 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_38719  predicted protein  100 
 
 
457 aa  949    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248337  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04610  conserved hypothetical protein  31.08 
 
 
434 aa  188  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  33.71 
 
 
335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  36.43 
 
 
361 aa  166  8e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  33.1 
 
 
342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  33.1 
 
 
342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 
329 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  35.97 
 
 
303 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  35.52 
 
 
332 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.65 
 
 
335 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  35.45 
 
 
353 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  36.33 
 
 
324 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  34.47 
 
 
388 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  35.83 
 
 
324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  35.38 
 
 
335 aa  154  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  35.92 
 
 
324 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  35.92 
 
 
324 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  35.92 
 
 
324 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  35.92 
 
 
324 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  33.22 
 
 
324 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  34.8 
 
 
324 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  34.62 
 
 
332 aa  150  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  36.03 
 
 
423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  34.23 
 
 
332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  35.77 
 
 
324 aa  146  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  35.77 
 
 
324 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  34.77 
 
 
362 aa  146  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  31.87 
 
 
328 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  31.94 
 
 
325 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.09 
 
 
354 aa  143  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  32.67 
 
 
308 aa  143  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  33.58 
 
 
356 aa  143  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  33.08 
 
 
329 aa  143  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  34.36 
 
 
372 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  34.36 
 
 
372 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03132  Zn-dependent hydrolase/oxidoreductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13010)  31.35 
 
 
414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.131518 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  34.48 
 
 
376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  33.98 
 
 
372 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  31.13 
 
 
335 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 
330 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  34.46 
 
 
320 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  31.02 
 
 
362 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  34.46 
 
 
320 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  34.46 
 
 
320 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  33.46 
 
 
365 aa  137  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  35.04 
 
 
320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  34.5 
 
 
377 aa  136  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  30.53 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  34.83 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  32.53 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  33.1 
 
 
320 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0514  outer membrane protein  33.83 
 
 
398 aa  136  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  35.55 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 
372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  31.44 
 
 
372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 
352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.1 
 
 
325 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 
409 aa  133  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  32.6 
 
 
353 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  32.97 
 
 
353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  30.19 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.09 
 
 
393 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  27.62 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  33.09 
 
 
371 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  33.2 
 
 
353 aa  131  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  31.05 
 
 
344 aa  131  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  31.2 
 
 
353 aa  131  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  31.87 
 
 
344 aa  131  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  31.99 
 
 
337 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  30.67 
 
 
364 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  33.06 
 
 
358 aa  130  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  32.54 
 
 
334 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  32.18 
 
 
362 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  28.99 
 
 
371 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.06 
 
 
374 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  32.45 
 
 
363 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  32.54 
 
 
336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  29.8 
 
 
369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  32.64 
 
 
381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.47 
 
 
374 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  31.7 
 
 
376 aa  126  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  30.68 
 
 
367 aa  126  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  33.47 
 
 
374 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01370  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 
361 aa  126  9e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  32.59 
 
 
333 aa  126  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  32.23 
 
 
350 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  30.83 
 
 
362 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  30.74 
 
 
324 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  31.47 
 
 
358 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  32.39 
 
 
367 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  32.64 
 
 
374 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.64 
 
 
374 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  32.64 
 
 
374 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  34.3 
 
 
358 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1825  outer membrane protein  31.75 
 
 
362 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  28.62 
 
 
330 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  31.78 
 
 
353 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.25 
 
 
380 aa  123  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.06 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2793  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.19 
 
 
378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>