239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_24223 on replicon NC_011699
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  100 
 
 
361 aa  751    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  40.74 
 
 
332 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  38.28 
 
 
362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  37.25 
 
 
342 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  37.25 
 
 
342 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  37.25 
 
 
329 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  42.52 
 
 
388 aa  186  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  39.85 
 
 
328 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  41.09 
 
 
335 aa  176  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  39.41 
 
 
356 aa  175  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  35.42 
 
 
335 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  38.77 
 
 
331 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  37.77 
 
 
336 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  40.3 
 
 
353 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  37.84 
 
 
369 aa  169  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  38.64 
 
 
361 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  37.46 
 
 
329 aa  168  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  38.93 
 
 
353 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  36.36 
 
 
365 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  38.61 
 
 
358 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  35.44 
 
 
403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03132  Zn-dependent hydrolase/oxidoreductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13010)  35.78 
 
 
414 aa  166  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.131518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  39.51 
 
 
360 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38719  predicted protein  36.43 
 
 
457 aa  166  5.9999999999999996e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248337  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  36.36 
 
 
376 aa  165  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  35.14 
 
 
358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  38.11 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  30.95 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  37.91 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  35.45 
 
 
324 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.43 
 
 
325 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  35.55 
 
 
423 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  35.22 
 
 
324 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  37.5 
 
 
362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  37.37 
 
 
332 aa  162  6e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.66 
 
 
393 aa  162  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  35.45 
 
 
324 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  35.45 
 
 
324 aa  162  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  35.45 
 
 
324 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  35.45 
 
 
324 aa  162  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01370  conserved hypothetical protein  34.07 
 
 
361 aa  162  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  36.96 
 
 
344 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.55 
 
 
354 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.67 
 
 
335 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  37.01 
 
 
332 aa  161  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04610  conserved hypothetical protein  33.52 
 
 
434 aa  161  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  35.45 
 
 
324 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  35.22 
 
 
324 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.27 
 
 
385 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  38.01 
 
 
330 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  37.64 
 
 
324 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  37.22 
 
 
351 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  39.76 
 
 
367 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  34.96 
 
 
383 aa  160  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  36.93 
 
 
371 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  35.22 
 
 
324 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  37.37 
 
 
372 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  39.38 
 
 
374 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  35.91 
 
 
357 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  35.38 
 
 
396 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  37.31 
 
 
336 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  34.65 
 
 
337 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  37.31 
 
 
303 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  33.93 
 
 
324 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  38.41 
 
 
353 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  38.41 
 
 
353 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  35.66 
 
 
330 aa  157  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  36.75 
 
 
353 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.18 
 
 
374 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  35.79 
 
 
362 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.67 
 
 
374 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  37.64 
 
 
364 aa  155  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.46 
 
 
374 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  35.92 
 
 
371 aa  155  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.46 
 
 
386 aa  155  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  33.33 
 
 
357 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  37.94 
 
 
358 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  36.46 
 
 
374 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  36.46 
 
 
374 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  36.29 
 
 
363 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  35.56 
 
 
372 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  36.94 
 
 
336 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  34.59 
 
 
372 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  36.12 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  35.85 
 
 
372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  35.85 
 
 
372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  39.15 
 
 
353 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  39.18 
 
 
352 aa  152  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  34.29 
 
 
368 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  36.1 
 
 
374 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  35.82 
 
 
380 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  31.75 
 
 
363 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  34.62 
 
 
366 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  33.33 
 
 
335 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.79 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  35.93 
 
 
409 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  36.68 
 
 
376 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  32.59 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  32.61 
 
 
320 aa  146  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  34.95 
 
 
364 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>