270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2802 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
352 aa  707    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  84.99 
 
 
353 aa  595  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  73.65 
 
 
353 aa  529  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  73.09 
 
 
353 aa  522  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  73.22 
 
 
353 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  73.37 
 
 
353 aa  511  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  56.75 
 
 
337 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  55.21 
 
 
329 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  56.13 
 
 
336 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  57.14 
 
 
330 aa  360  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  56.17 
 
 
351 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  54.77 
 
 
353 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  53.23 
 
 
334 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  57.89 
 
 
328 aa  349  4e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  55.05 
 
 
332 aa  344  1e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  54.21 
 
 
324 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  54.91 
 
 
332 aa  342  8e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  54.46 
 
 
331 aa  339  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  55.49 
 
 
330 aa  339  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  53.44 
 
 
353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  47.4 
 
 
344 aa  289  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  45.09 
 
 
358 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  39.58 
 
 
336 aa  252  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  46.88 
 
 
325 aa  249  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  44.16 
 
 
325 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  42.3 
 
 
361 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  41.18 
 
 
362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.1 
 
 
354 aa  232  9e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  36.94 
 
 
335 aa  229  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  43.12 
 
 
344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  39.18 
 
 
362 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  37.27 
 
 
332 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  37.85 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  37.85 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  37.85 
 
 
329 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  35.91 
 
 
357 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  39.5 
 
 
362 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  40.57 
 
 
335 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  40.16 
 
 
358 aa  170  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  38.74 
 
 
376 aa  169  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  35.14 
 
 
324 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  36.63 
 
 
303 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40.87 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  38.1 
 
 
356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  30.58 
 
 
364 aa  162  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  34.73 
 
 
324 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 
324 aa  162  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  38.02 
 
 
361 aa  162  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  38.84 
 
 
364 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  34.35 
 
 
324 aa  162  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  33.71 
 
 
324 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  35.74 
 
 
409 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.35 
 
 
385 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  33.21 
 
 
324 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  37.45 
 
 
388 aa  159  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  32.83 
 
 
423 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  34.77 
 
 
358 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  36.96 
 
 
372 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  36.96 
 
 
372 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  36.96 
 
 
372 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.84 
 
 
386 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  35.6 
 
 
351 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  35.98 
 
 
369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  34.98 
 
 
372 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03132  Zn-dependent hydrolase/oxidoreductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13010)  33.1 
 
 
414 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.131518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  33.65 
 
 
367 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.63 
 
 
374 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  34.66 
 
 
366 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  34.75 
 
 
368 aa  149  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  34.26 
 
 
357 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.56 
 
 
353 aa  149  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.63 
 
 
374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  34.32 
 
 
383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  34.39 
 
 
308 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  34.14 
 
 
336 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  34.17 
 
 
363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  36.44 
 
 
360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  35.22 
 
 
363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  35.86 
 
 
362 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0514  outer membrane protein  32.41 
 
 
398 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  36.1 
 
 
374 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  35.71 
 
 
351 aa  146  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  34.44 
 
 
350 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  33.72 
 
 
335 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  36.15 
 
 
374 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  36.5 
 
 
365 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.11 
 
 
374 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  34.11 
 
 
374 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  34.11 
 
 
374 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  36.56 
 
 
396 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  38.19 
 
 
371 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  35.14 
 
 
380 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  32.37 
 
 
318 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  34.1 
 
 
358 aa  142  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 
372 aa  142  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04610  conserved hypothetical protein  31.94 
 
 
434 aa  141  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>