266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2834 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  677    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 329 aa  676    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 342 aa  677    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  63.53 
 
 		 332 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  41.14 
 
 		 362 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  40.52 
 
 		 361 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  39.54 
 
 		 362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.62 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.66 
 
 		 354 aa  197  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  40.39 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  37.25 
 
 		 361 aa  194  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  39.46 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  36.46 
 
 		 423 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  37.18 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  39.07 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  34.6 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  37 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  36.31 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  35.31 
 
 		 335 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  36.46 
 
 		 324 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  36.46 
 
 		 324 aa  189  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  36.46 
 
 		 324 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  41.42 
 
 		 372 aa  188  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  33.76 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  36.56 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  36.46 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  36.46 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.66 
 
 		 335 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  36.46 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  37.54 
 
 		 332 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  39.25 
 
 		 335 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  38.41 
 
 		 364 aa  186  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  39.23 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.704278 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03132  Zn-dependent hydrolase/oxidoreductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13010)  36.92 
 
 		 414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.131518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  38.58 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  36.89 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  36.89 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  36.07 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  40.31 
 
 		 344 aa  183  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 		 353 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  36.57 
 
 		 372 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  36.17 
 
 		 376 aa  182  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  37.12 
 
 		 332 aa  182  6e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04610  conserved hypothetical protein  36.19 
 
 		 434 aa  182  7e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  42.08 
 
 		 388 aa  182  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  42.08 
 
 		 371 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  33.69 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  37.24 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  38.8 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  36.57 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  36.78 
 
 		 371 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  35.74 
 
 		 324 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40.4 
 
 		 393 aa  179  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01370  conserved hypothetical protein  34.48 
 
 		 361 aa  179  5.999999999999999e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  42.21 
 
 		 353 aa  179  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  35.67 
 
 		 353 aa  178  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  38.46 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  37 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  32.83 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  33.74 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  38.46 
 
 		 353 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  36.34 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  37.25 
 
 		 372 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  37.85 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  40.93 
 
 		 362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  36.48 
 
 		 353 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  34.08 
 
 		 369 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  35.34 
 
 		 320 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  35.88 
 
 		 320 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  35.88 
 
 		 320 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  36.67 
 
 		 363 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  40.25 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  35.5 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  40.5 
 
 		 367 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  35.11 
 
 		 320 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  38.91 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  42.79 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  35.05 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  33.83 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  38.08 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 		 409 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  37.05 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  34.59 
 
 		 383 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  35.11 
 
 		 320 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  31.17 
 
 		 375 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  35.34 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  38.52 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  40.45 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  34.96 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  34.18 
 
 		 377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  39.56 
 
 		 396 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  38.17 
 
 		 351 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.45 
 
 		 374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  33.86 
 
 		 380 aa  165  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  31.6 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  38.93 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  38.4 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  37.45 
 
 		 376 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  38.68 
 
 		 350 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>