227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6668 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  93.58 
 
 
374 aa  715    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  99.2 
 
 
374 aa  749    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  90.64 
 
 
374 aa  693    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  99.2 
 
 
374 aa  749    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  100 
 
 
374 aa  755    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  90.91 
 
 
374 aa  700    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  81.4 
 
 
380 aa  618  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  78.34 
 
 
374 aa  609  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  79.51 
 
 
376 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  79.51 
 
 
376 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  79.55 
 
 
381 aa  591  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  65.53 
 
 
357 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  68.28 
 
 
363 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  65.23 
 
 
358 aa  455  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  62.2 
 
 
366 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  59.76 
 
 
363 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  61.71 
 
 
362 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  62.65 
 
 
363 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  60.96 
 
 
350 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  61.06 
 
 
368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1097  Zn-dependent hydrolase  59.47 
 
 
366 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  52.32 
 
 
383 aa  371  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3122  metallo-beta-lactamase family protein  57.64 
 
 
355 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  50.43 
 
 
369 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  54.15 
 
 
358 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  53.31 
 
 
362 aa  349  4e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  51.08 
 
 
356 aa  349  5e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  51.08 
 
 
356 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  51.39 
 
 
372 aa  347  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  47.29 
 
 
364 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  46.88 
 
 
376 aa  345  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  47.71 
 
 
364 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  51.38 
 
 
367 aa  333  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  53.45 
 
 
318 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  47.16 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  44.38 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  45.45 
 
 
351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  45.43 
 
 
365 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  48.66 
 
 
336 aa  261  8.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  39.09 
 
 
377 aa  260  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  44.41 
 
 
386 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  45.27 
 
 
409 aa  258  8e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  48.26 
 
 
372 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  48.26 
 
 
372 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  47.54 
 
 
371 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  43.79 
 
 
367 aa  257  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  44.34 
 
 
351 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  48.26 
 
 
372 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  43.64 
 
 
360 aa  255  8e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  42.76 
 
 
320 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  42.76 
 
 
320 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  42.99 
 
 
372 aa  250  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  40.97 
 
 
320 aa  249  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  43.59 
 
 
320 aa  249  7e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  41.72 
 
 
320 aa  249  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  40.62 
 
 
320 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  42.55 
 
 
353 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  42.96 
 
 
320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  42.39 
 
 
372 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  41.54 
 
 
376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  40.55 
 
 
371 aa  233  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  35.53 
 
 
363 aa  231  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.36 
 
 
367 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  47.31 
 
 
358 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.9 
 
 
419 aa  230  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  40.5 
 
 
375 aa  227  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  40.46 
 
 
403 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  37.98 
 
 
361 aa  224  2e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.74 
 
 
393 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  38.3 
 
 
367 aa  222  7e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  35.91 
 
 
333 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  34.92 
 
 
353 aa  216  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2793  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.83 
 
 
378 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  34.29 
 
 
354 aa  210  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  38.18 
 
 
361 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.2 
 
 
380 aa  209  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  42.26 
 
 
414 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  44.4 
 
 
396 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  42.8 
 
 
377 aa  206  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  38.01 
 
 
320 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  37.33 
 
 
320 aa  203  4e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  42.07 
 
 
332 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  38.02 
 
 
392 aa  196  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  34.84 
 
 
361 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.54 
 
 
354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  35.42 
 
 
362 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  39.57 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  38.66 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  32.34 
 
 
342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  32.34 
 
 
342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 
329 aa  162  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  34.8 
 
 
362 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  36.47 
 
 
308 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  37.92 
 
 
344 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  37.9 
 
 
324 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  37.9 
 
 
324 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  37.9 
 
 
324 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  37.9 
 
 
324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  37.44 
 
 
324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  36.46 
 
 
361 aa  155  9e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>