More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0215 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 409 aa  798    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  56.49 
 
 		 372 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  56.49 
 
 		 372 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  56.49 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  57.95 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  57.61 
 
 		 372 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  58.26 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  56.23 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  57.56 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  57.31 
 
 		 353 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  56.45 
 
 		 385 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  56.28 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  57.45 
 
 		 367 aa  368  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  55.59 
 
 		 386 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  53.52 
 
 		 396 aa  349  6e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  49.55 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  49.84 
 
 		 388 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  47.47 
 
 		 358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  47.13 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  40.7 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  42.66 
 
 		 369 aa  262  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  38.01 
 
 		 320 aa  259  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  45.27 
 
 		 374 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  37.38 
 
 		 320 aa  259  8e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  37.38 
 
 		 320 aa  259  8e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  45.27 
 
 		 374 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  45.27 
 
 		 374 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  34.41 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  42.16 
 
 		 376 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 		 363 aa  256  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  37.3 
 
 		 320 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  40 
 
 		 358 aa  256  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  44.64 
 
 		 374 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  42.09 
 
 		 336 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  42.94 
 
 		 374 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  36.76 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  42.2 
 
 		 358 aa  253  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  42.46 
 
 		 374 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  36.76 
 
 		 320 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  41.98 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  42.77 
 
 		 374 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  38.67 
 
 		 364 aa  250  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  43.06 
 
 		 318 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  36.45 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  42.95 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  41.94 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  43.79 
 
 		 362 aa  246  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  43.28 
 
 		 367 aa  245  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  39.02 
 
 		 364 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  37.08 
 
 		 376 aa  244  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  42.73 
 
 		 381 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  40.99 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  41.93 
 
 		 350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  40.37 
 
 		 356 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2793  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.96 
 
 		 378 aa  243  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  43.37 
 
 		 363 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  36.36 
 
 		 383 aa  240  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  43.52 
 
 		 376 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  39.01 
 
 		 333 aa  239  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  42.11 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  41.62 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  41.82 
 
 		 376 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.76 
 
 		 380 aa  237  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  42.2 
 
 		 366 aa  235  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  43.38 
 
 		 363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  39.82 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  36.29 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  40.07 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  37.15 
 
 		 361 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.74 
 
 		 367 aa  229  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  38.14 
 
 		 361 aa  226  7e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  43.98 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  35.4 
 
 		 354 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  35.8 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  36.09 
 
 		 377 aa  213  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.66 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1097  Zn-dependent hydrolase  41.13 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3122  metallo-beta-lactamase family protein  44.98 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  41.18 
 
 		 332 aa  202  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  36.2 
 
 		 414 aa  199  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  34.01 
 
 		 392 aa  189  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  31.25 
 
 		 320 aa  187  4e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  30.48 
 
 		 320 aa  186  8e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  41.24 
 
 		 335 aa  176  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  35.88 
 
 		 336 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  35.6 
 
 		 342 aa  172  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  35.6 
 
 		 342 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  38.31 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  42.74 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  40.91 
 
 		 361 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  37.22 
 
 		 329 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  39.18 
 
 		 353 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  39.18 
 
 		 353 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  38.33 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.8 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  39.54 
 
 		 362 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  36.76 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  40.25 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  39.25 
 
 		 353 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>