214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0218 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 351 aa  711    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  78.55 
 
 		 353 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  79.09 
 
 		 353 aa  544  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  79.32 
 
 		 324 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  73.86 
 
 		 330 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  55.02 
 
 		 329 aa  360  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  52.82 
 
 		 353 aa  359  4e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  53.67 
 
 		 353 aa  358  6e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  52.26 
 
 		 353 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  53.95 
 
 		 353 aa  352  8e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  53.12 
 
 		 352 aa  348  9e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  51.99 
 
 		 337 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  52.15 
 
 		 336 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  51.38 
 
 		 334 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  52.54 
 
 		 353 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  53.58 
 
 		 330 aa  336  5e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  50.91 
 
 		 331 aa  335  7.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  53.56 
 
 		 328 aa  315  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  49.84 
 
 		 344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  48.47 
 
 		 332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  48 
 
 		 332 aa  301  1e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  48.43 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  46.01 
 
 		 336 aa  299  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  48.74 
 
 		 325 aa  275  9e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  43.27 
 
 		 362 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  44.13 
 
 		 361 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  45.42 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.96 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  43.48 
 
 		 344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  40.68 
 
 		 335 aa  226  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  40.53 
 
 		 332 aa  215  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  41.35 
 
 		 362 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  35.71 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  36.19 
 
 		 308 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  39.77 
 
 		 303 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  34.31 
 
 		 324 aa  186  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  35.67 
 
 		 324 aa  185  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  35.03 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  37.1 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  35.67 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  34.97 
 
 		 324 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  34.28 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  34.71 
 
 		 324 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  34.71 
 
 		 324 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  34.71 
 
 		 324 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  34.71 
 
 		 324 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 329 aa  179  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  33.72 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  33.72 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  39.31 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  35.56 
 
 		 335 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  39.39 
 
 		 356 aa  169  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  34.78 
 
 		 372 aa  169  8e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  36.3 
 
 		 372 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  36.3 
 
 		 372 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  36.3 
 
 		 372 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.93 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  37.23 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  39.13 
 
 		 364 aa  162  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  34.36 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  39.57 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  38.27 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  37.22 
 
 		 361 aa  160  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2793  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.59 
 
 		 378 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  36.96 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  34.85 
 
 		 364 aa  160  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  40.72 
 
 		 369 aa  159  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  38.63 
 
 		 371 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  35.76 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03132  Zn-dependent hydrolase/oxidoreductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13010)  31.76 
 
 		 414 aa  156  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.131518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  38.02 
 
 		 358 aa  156  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  35.29 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  38.17 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  35.77 
 
 		 358 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  36.96 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  39.26 
 
 		 350 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  36.96 
 
 		 367 aa  152  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  35.93 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.98 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  33.33 
 
 		 360 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  35.07 
 
 		 351 aa  150  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.9 
 
 		 386 aa  149  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.68 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5524  hypothetical protein  31.77 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608927  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.26 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  34.53 
 
 		 371 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  35.16 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  34.18 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  35.41 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.29 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  37.07 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  31.25 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  36.29 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  31.74 
 
 		 348 aa  143  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  36.32 
 
 		 363 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  33.58 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  38.28 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33 
 
 		 353 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  35.14 
 
 		 296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  35.32 
 
 		 372 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>