238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0952 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  678    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  99.1 
 
 		 332 aa  671    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  55.76 
 
 		 328 aa  352  5.9999999999999994e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  54.91 
 
 		 352 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  52.81 
 
 		 330 aa  329  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  53.11 
 
 		 353 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  51.06 
 
 		 329 aa  319  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  54.35 
 
 		 353 aa  317  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  52.02 
 
 		 353 aa  315  9e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  52.02 
 
 		 353 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  49.09 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  50.61 
 
 		 331 aa  305  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  48.47 
 
 		 324 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  52.65 
 
 		 353 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  49.85 
 
 		 334 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  47.66 
 
 		 353 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  48.31 
 
 		 351 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  49.39 
 
 		 330 aa  299  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  47.53 
 
 		 353 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  48.61 
 
 		 336 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  49.04 
 
 		 325 aa  277  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  46.01 
 
 		 358 aa  278  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  44.85 
 
 		 362 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  44.05 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  45.71 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.84 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  44.58 
 
 		 361 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  43.38 
 
 		 336 aa  249  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.56 
 
 		 354 aa  229  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  41.62 
 
 		 362 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  42.86 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  43.35 
 
 		 303 aa  199  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  42.97 
 
 		 332 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  38.17 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  37.54 
 
 		 329 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  37.54 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  37.54 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.87 
 
 		 335 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  32.06 
 
 		 308 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  35.56 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  38.66 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  34.6 
 
 		 324 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  35.24 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  32.48 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  33.12 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  33.12 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  33.23 
 
 		 335 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  32.8 
 
 		 324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  32.8 
 
 		 324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  32.8 
 
 		 324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  33.97 
 
 		 324 aa  165  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  38.8 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  37.37 
 
 		 361 aa  162  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  31.76 
 
 		 423 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03132  Zn-dependent hydrolase/oxidoreductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13010)  35.59 
 
 		 414 aa  161  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.131518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  40.65 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  37.4 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  36.29 
 
 		 376 aa  156  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0514  outer membrane protein  34.47 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04610  conserved hypothetical protein  32.09 
 
 		 434 aa  153  5e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  37.46 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  37.05 
 
 		 364 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  37.16 
 
 		 372 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  36.59 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  37.16 
 
 		 372 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  37.16 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.85 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38719  predicted protein  34.62 
 
 		 457 aa  150  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  36.33 
 
 		 333 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36 
 
 		 386 aa  149  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  35.25 
 
 		 358 aa  149  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  32.9 
 
 		 364 aa  149  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  34.35 
 
 		 369 aa  149  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  37.14 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.62 
 
 		 353 aa  146  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  36.58 
 
 		 388 aa  145  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  35.66 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  30.22 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  29.76 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  33.33 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  36.42 
 
 		 372 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  29.81 
 
 		 356 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  31.51 
 
 		 367 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  33.09 
 
 		 376 aa  141  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  32.38 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  33.74 
 
 		 350 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  36.86 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 		 409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  36.43 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 		 367 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  36.86 
 
 		 371 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  34.3 
 
 		 351 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  33.33 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  35.92 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  36.22 
 
 		 371 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5524  hypothetical protein  31.46 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608927  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  39.38 
 
 		 396 aa  136  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  33.23 
 
 		 374 aa  136  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  32.56 
 
 		 363 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  31.85 
 
 		 318 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>