265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5524 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5524  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  689    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608927  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  54.94 
 
 
348 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  37.96 
 
 
324 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  37.96 
 
 
324 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  35.9 
 
 
324 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  36.26 
 
 
324 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  35.9 
 
 
324 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  35.9 
 
 
324 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  35.9 
 
 
324 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  34.01 
 
 
362 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  36.23 
 
 
423 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  36.26 
 
 
324 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  37 
 
 
324 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  36.63 
 
 
324 aa  169  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  33.68 
 
 
303 aa  169  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  33.22 
 
 
335 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  33.33 
 
 
330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  35.57 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  34.35 
 
 
332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  33.99 
 
 
335 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  32.14 
 
 
361 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  37.6 
 
 
335 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  31.16 
 
 
342 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  31.16 
 
 
342 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 
329 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  33.66 
 
 
353 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.68 
 
 
335 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.15 
 
 
354 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  31.38 
 
 
353 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  35.93 
 
 
364 aa  149  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  31.99 
 
 
325 aa  149  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  32.76 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  31.79 
 
 
351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  31.01 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0514  outer membrane protein  30.46 
 
 
398 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.43 
 
 
325 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  32.12 
 
 
324 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  32.37 
 
 
356 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  32.42 
 
 
362 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  28.48 
 
 
376 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  32.41 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  30.58 
 
 
367 aa  139  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  31.96 
 
 
336 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  36.33 
 
 
296 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  34.89 
 
 
364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  31.46 
 
 
332 aa  136  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  31.46 
 
 
332 aa  136  5e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  32.33 
 
 
330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 
353 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  30.03 
 
 
351 aa  135  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  30.77 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  30.89 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 
329 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  34.19 
 
 
358 aa  133  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  33.91 
 
 
362 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.27 
 
 
380 aa  132  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  28.26 
 
 
376 aa  132  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  33.86 
 
 
369 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  30.51 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  31.23 
 
 
353 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 
352 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  29.34 
 
 
377 aa  130  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  30.93 
 
 
351 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.67 
 
 
393 aa  129  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.38 
 
 
367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  30.34 
 
 
353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  28.79 
 
 
353 aa  125  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  30.34 
 
 
353 aa  125  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  30.3 
 
 
344 aa  125  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  28.41 
 
 
354 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1825  outer membrane protein  29.59 
 
 
362 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.22 
 
 
419 aa  124  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  29.81 
 
 
336 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  28.3 
 
 
363 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  27.08 
 
 
361 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  29.03 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  30.37 
 
 
363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  26.54 
 
 
320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  28.75 
 
 
337 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  26.54 
 
 
320 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  29.64 
 
 
336 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  26.54 
 
 
320 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  29.47 
 
 
334 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.91 
 
 
353 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  26.54 
 
 
320 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  26.55 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  30.95 
 
 
357 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
363 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  25.77 
 
 
320 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  30.23 
 
 
371 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38719  predicted protein  29.76 
 
 
457 aa  117  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248337  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.73 
 
 
374 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  27.63 
 
 
365 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04610  conserved hypothetical protein  31.12 
 
 
434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.26 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.57 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.96 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  29.48 
 
 
362 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  28.24 
 
 
367 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  30.34 
 
 
388 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>