123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6475 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6475  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 538 aa  1113    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2096  beta-lactamase domain-containing protein  45.42 
 
 		 535 aa  512  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.894663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5192  hypothetical protein  43.1 
 
 		 541 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_003296  RS03728  hypothetical protein  44.7 
 
 		 537 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.42275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3422  beta-lactamase domain protein  43.69 
 
 		 535 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3062  hypothetical protein  43.76 
 
 		 534 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.838657  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0135  polyketide synthase  39.85 
 
 		 530 aa  360  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1563  metallo-beta-lactamase family protein  39.85 
 
 		 530 aa  360  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.177034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1644  metallo-beta-lactamase family protein  39.85 
 
 		 530 aa  359  7e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1238  polyketide synthase  39.48 
 
 		 530 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  32.75 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  36.88 
 
 		 362 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  40.82 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  40.21 
 
 		 334 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0163  hypothetical protein  27.87 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000295747 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  28.49 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  34.59 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  37.23 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  37.69 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  30.54 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.25 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  42.7 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.61 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  38.37 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  35.77 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  43.18 
 
 		 331 aa  60.1  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  33.04 
 
 		 333 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  28.57 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  28.57 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  28.57 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  35.64 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  28.57 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4170  hypothetical protein  30.52 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  36.7 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  33.98 
 
 		 324 aa  57  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  32.52 
 
 		 344 aa  57  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  35.09 
 
 		 324 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  32.41 
 
 		 361 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  34.21 
 
 		 423 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  34.51 
 
 		 324 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  35.96 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  35.09 
 
 		 324 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  33.07 
 
 		 353 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.14 
 
 		 386 aa  55.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  42.53 
 
 		 353 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  27.08 
 
 		 361 aa  54.3  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  37.62 
 
 		 354 aa  53.9  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 		 353 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  31.71 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  37.25 
 
 		 353 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.57 
 
 		 385 aa  52.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  33.88 
 
 		 353 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  31.71 
 
 		 353 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  33.67 
 
 		 376 aa  52  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  28.18 
 
 		 332 aa  51.6  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  28.36 
 
 		 336 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 330 aa  51.6  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  24 
 
 		 308 aa  51.6  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  33.58 
 
 		 362 aa  51.2  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  38.46 
 
 		 388 aa  50.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  34.83 
 
 		 342 aa  50.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  26.32 
 
 		 377 aa  50.4  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  34.83 
 
 		 342 aa  50.4  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0666  beta-lactamase domain protein  35.37 
 
 		 229 aa  50.1  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389415  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 		 329 aa  50.4  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0188  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.77 
 
 		 548 aa  50.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  28.15 
 
 		 356 aa  50.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 332 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  30.61 
 
 		 363 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1068  Beta-lactamase-like  25.26 
 
 		 274 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  32.35 
 
 		 216 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  27.62 
 
 		 332 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 274 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1152  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.25 
 
 		 521 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142651  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  38.98 
 
 		 225 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  38.37 
 
 		 328 aa  48.9  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1196  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 274 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  43.42 
 
 		 352 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  31.01 
 
 		 335 aa  48.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.45 
 
 		 590 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2965  hypothetical protein  30.65 
 
 		 252 aa  48.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0145434  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1021  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.75 
 
 		 312 aa  48.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  27.27 
 
 		 325 aa  47.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  47.4  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  47.27 
 
 		 602 aa  47.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13852  hypothetical protein  29.92 
 
 		 516 aa  47  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2786  beta-lactamase domain-containing protein  35.62 
 
 		 225 aa  47  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.480164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  32.99 
 
 		 360 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01370  conserved hypothetical protein  29.31 
 
 		 361 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  26.61 
 
 		 335 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.81 
 
 		 335 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2206  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.81 
 
 		 516 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0475184  normal  0.51009 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  38.98 
 
 		 226 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  33.71 
 
 		 367 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.75 
 
 		 393 aa  46.2  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  23.57 
 
 		 320 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  25.18 
 
 		 320 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  27.27 
 
 		 365 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  27.12 
 
 		 348 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>