101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3422 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2096  beta-lactamase domain-containing protein  56.66 
 
 		 535 aa  647    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.894663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3422  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 535 aa  1103    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5192  hypothetical protein  62.26 
 
 		 541 aa  694    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_003296  RS03728  hypothetical protein  51.13 
 
 		 537 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.42275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3062  hypothetical protein  45.03 
 
 		 534 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.838657  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6475  beta-lactamase domain-containing protein  43.69 
 
 		 538 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0135  polyketide synthase  41.68 
 
 		 530 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1563  metallo-beta-lactamase family protein  41.68 
 
 		 530 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.177034  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1238  polyketide synthase  40.92 
 
 		 530 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1644  metallo-beta-lactamase family protein  41.68 
 
 		 530 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  23.6 
 
 		 361 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  28.72 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  28.19 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.92 
 
 		 590 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  28.19 
 
 		 324 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  27.13 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  27.13 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  27.13 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  30.34 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  26.74 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  25.6 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  21.97 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3103  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.27 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  34.52 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  23.34 
 
 		 333 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 324 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  29.2 
 
 		 362 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  21.35 
 
 		 376 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  26.74 
 
 		 324 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  26.74 
 
 		 324 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  27.83 
 
 		 375 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  26.67 
 
 		 362 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  25.14 
 
 		 353 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  25.67 
 
 		 324 aa  52  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  26.6 
 
 		 324 aa  52  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  23.67 
 
 		 342 aa  51.2  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  23.67 
 
 		 342 aa  51.2  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  23.67 
 
 		 329 aa  51.2  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0163  hypothetical protein  28.04 
 
 		 440 aa  50.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000295747 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  32 
 
 		 358 aa  50.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  22.42 
 
 		 335 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  29.1 
 
 		 351 aa  50.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  24.34 
 
 		 388 aa  50.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.73 
 
 		 335 aa  50.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.35 
 
 		 380 aa  50.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.37 
 
 		 367 aa  50.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  35.38 
 
 		 216 aa  50.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  20.74 
 
 		 356 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.79 
 
 		 354 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 		 353 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  34.23 
 
 		 353 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4170  hypothetical protein  27.42 
 
 		 253 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  40.91 
 
 		 211 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 		 332 aa  48.5  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  38.33 
 
 		 241 aa  48.5  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  35.37 
 
 		 329 aa  48.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  25.48 
 
 		 353 aa  48.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  36.78 
 
 		 331 aa  47.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  34.09 
 
 		 336 aa  47.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  25.81 
 
 		 383 aa  47.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  20.96 
 
 		 361 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  22.34 
 
 		 358 aa  47  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  25.4 
 
 		 308 aa  47  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  25.64 
 
 		 233 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  20.67 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  37 
 
 		 353 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  34.23 
 
 		 353 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  26.83 
 
 		 320 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  21.69 
 
 		 351 aa  47  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  36.92 
 
 		 211 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  21.27 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  33.33 
 
 		 353 aa  46.2  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  23.9 
 
 		 320 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.74 
 
 		 481 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0666  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 229 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2206  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.84 
 
 		 516 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0475184  normal  0.51009 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  21.86 
 
 		 362 aa  45.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2570  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  23.12 
 
 		 258 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.950272  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1330  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.84 
 
 		 529 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  27.96 
 
 		 320 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  28.46 
 
 		 335 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  27.78 
 
 		 325 aa  44.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  28.28 
 
 		 330 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2467  hypothetical protein  28.28 
 
 		 292 aa  44.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  21.98 
 
 		 351 aa  44.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 		 363 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.84 
 
 		 529 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  25.61 
 
 		 320 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1769  metal-dependent hydrolase  28.33 
 
 		 234 aa  44.3  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1515  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.5 
 
 		 469 aa  44.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  23.81 
 
 		 320 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  25 
 
 		 320 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  25 
 
 		 320 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  20.77 
 
 		 332 aa  43.9  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  33.9 
 
 		 219 aa  44.3  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 		 352 aa  43.9  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1725  beta-lactamase domain protein  36.67 
 
 		 235 aa  43.9  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.76 
 
 		 393 aa  43.9  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2464  outer membrane protein  25 
 
 		 159 aa  43.5  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>