129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38030 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  100 
 
 		 211 aa  423  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6881  beta-lactamase domain protein  49.29 
 
 		 207 aa  215  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  47.66 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10801  hypothetical protein  46.08 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3615  beta-lactamase domain protein  45.89 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  42.99 
 
 		 216 aa  174  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1622  beta-lactamase domain-containing protein  44.14 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5131  beta-lactamase domain-containing protein  43.95 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4555  beta-lactamase-like protein  46.31 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4643  beta-lactamase domain-containing protein  46.31 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4938  beta-lactamase domain-containing protein  46.31 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5062  beta-lactamase domain protein  40.87 
 
 		 209 aa  157  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8107  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.17 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4981  beta-lactamase domain-containing protein  42.39 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220064 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  41.86 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35790  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  40.61 
 
 		 213 aa  141  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3973  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.11 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  39.5 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  42.37 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0779  beta-lactamase domain-containing protein  40.1 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  35.94 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0058  hypothetical protein  38.5 
 
 		 212 aa  131  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2372  hypothetical protein  35.42 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000518182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0834  beta-lactamase domain-containing protein  38.16 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.572776  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2841  beta-lactamase domain-containing protein  35.05 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1742  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.95 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611049  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2637  hypothetical protein  38.89 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.48007  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1881  Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  34.33 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  30.22 
 
 		 223 aa  72  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  26.48 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  30.32 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  25 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  27.4 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  29.89 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  28.27 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  27.32 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  28.75 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0341  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.58 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2965  hypothetical protein  28.08 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0145434  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  29.91 
 
 		 320 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  30.28 
 
 		 351 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  30.16 
 
 		 376 aa  52.4  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16670  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  29.41 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.242022 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  26.8 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  24.53 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  27.27 
 
 		 320 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1324  putative L-ascorbate-6-phosphate lactonase UlaG  26.37 
 
 		 353 aa  50.1  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  27.27 
 
 		 320 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1586  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.51 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.600595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  27.98 
 
 		 353 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0396  hypothetical protein  23.77 
 
 		 246 aa  48.9  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.565727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0944  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.9 
 
 		 277 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10861  hypothetical protein  23.77 
 
 		 246 aa  48.5  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208613 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2464  outer membrane protein  33.78 
 
 		 159 aa  48.5  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287892  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0135  polyketide synthase  30 
 
 		 530 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1644  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 		 530 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1563  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 		 530 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.177034  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  26.17 
 
 		 320 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  26.36 
 
 		 320 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  28.57 
 
 		 362 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.6 
 
 		 386 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4450  hypothetical protein  29.38 
 
 		 270 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  26.17 
 
 		 320 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1093  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  28.72 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  26.78 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0151  metallo-beta-lactamase family protein  26.41 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  38.81 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  26.38 
 
 		 358 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2096  beta-lactamase domain-containing protein  43.75 
 
 		 535 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.894663  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1769  metal-dependent hydrolase  25.51 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3422  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 		 535 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  25.23 
 
 		 320 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.5 
 
 		 385 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.57 
 
 		 380 aa  45.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1816  beta-lactamase domain-containing protein  27.22 
 
 		 265 aa  45.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  26.04 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1238  polyketide synthase  29.05 
 
 		 530 aa  45.4  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2467  hypothetical protein  27.98 
 
 		 292 aa  45.1  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  27.56 
 
 		 409 aa  45.1  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  31.01 
 
 		 351 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  27.54 
 
 		 361 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0574  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.087898  normal  0.169456 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0204  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  31.86 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000768603  normal  0.146366 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1933  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  24.44 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6275  hypothetical protein  24.21 
 
 		 281 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0543  beta-lactamase domain protein  36.76 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  23.28 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  29.02 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  28.5 
 
 		 292 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.23 
 
 		 367 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  30 
 
 		 362 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  25.58 
 
 		 403 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0163  hypothetical protein  20.61 
 
 		 440 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000295747 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2337  beta-lactamase domain protein  26.8 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.52 
 
 		 393 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  26.61 
 
 		 351 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  30.1 
 
 		 371 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>