44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3615 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3615  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 215 aa  432  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5131  beta-lactamase domain-containing protein  59.63 
 
 		 218 aa  245  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10801  hypothetical protein  57.75 
 
 		 212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1622  beta-lactamase domain-containing protein  60.7 
 
 		 216 aa  241  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4555  beta-lactamase-like protein  58.42 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4938  beta-lactamase domain-containing protein  58.42 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4643  beta-lactamase domain-containing protein  58.42 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  54.59 
 
 		 219 aa  235  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  48.26 
 
 		 216 aa  181  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  45.89 
 
 		 211 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6881  beta-lactamase domain protein  46.51 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  42.11 
 
 		 241 aa  158  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5062  beta-lactamase domain protein  43.39 
 
 		 209 aa  147  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0834  beta-lactamase domain-containing protein  43.39 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.572776  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0779  beta-lactamase domain-containing protein  43.39 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4981  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220064 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2372  hypothetical protein  35.56 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000518182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  38.73 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  40.47 
 
 		 211 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  37.44 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0058  hypothetical protein  37.62 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35790  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  36.45 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3973  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.45 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8107  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.49 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1742  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.6 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  33 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2841  beta-lactamase domain-containing protein  32.88 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1881  Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  37.98 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2637  hypothetical protein  34.94 
 
 		 190 aa  92  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.48007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  25.14 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  27.46 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  29.26 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  28.12 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2464  outer membrane protein  30.93 
 
 		 159 aa  45.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287892  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  28.04 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0072  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.58 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2570  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  26.04 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.950272  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  26.14 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  29.9 
 
 		 320 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  29.9 
 
 		 320 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  25.66 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  29.9 
 
 		 320 aa  42  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  29.9 
 
 		 320 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2096  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 535 aa  41.6  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.894663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>