49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2372 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2372  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000518182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2637  hypothetical protein  68.75 
 
 
190 aa  229  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.48007  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0779  beta-lactamase domain-containing protein  44.7 
 
 
209 aa  199  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8107  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  48.17 
 
 
213 aa  198  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2841  beta-lactamase domain-containing protein  45.87 
 
 
210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0058  hypothetical protein  46.79 
 
 
212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3973  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  42.66 
 
 
214 aa  184  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0834  beta-lactamase domain-containing protein  42.4 
 
 
209 aa  182  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.572776  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35790  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  45.41 
 
 
213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4981  beta-lactamase domain-containing protein  42.08 
 
 
209 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220064 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1742  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40.27 
 
 
219 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  46.03 
 
 
211 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
211 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  40.19 
 
 
215 aa  149  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  41.46 
 
 
216 aa  144  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  35.42 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3615  beta-lactamase domain protein  35.56 
 
 
215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10801  hypothetical protein  34.43 
 
 
212 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1881  Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  36.53 
 
 
214 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6881  beta-lactamase domain protein  35.78 
 
 
207 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  35.23 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1622  beta-lactamase domain-containing protein  32.3 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5062  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4938  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 
217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5131  beta-lactamase domain-containing protein  30.09 
 
 
218 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4643  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 
217 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4555  beta-lactamase-like protein  30.41 
 
 
217 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  32.64 
 
 
241 aa  98.2  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3786  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 
243 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.295357 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  25 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  26.71 
 
 
220 aa  45.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09183  putative metal-dependent hydrolase  22.34 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607675  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  24.38 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.67 
 
 
256 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1362  metal-dependent hydrolase  28.8 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0022  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
266 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0022  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
266 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 
548 aa  42.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  31.53 
 
 
251 aa  42.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2530  metallo-beta-lactamase family protein YycJ  31.63 
 
 
266 aa  42.7  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.22966  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2229  beta-lactamase domain-containing protein  37.08 
 
 
230 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0154515  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2914  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  32.5 
 
 
255 aa  42.4  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  27.39 
 
 
226 aa  42  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  25.13 
 
 
223 aa  42.4  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  25.77 
 
 
223 aa  42  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1324  putative L-ascorbate-6-phosphate lactonase UlaG  26.54 
 
 
353 aa  41.6  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0574  beta-lactamase domain-containing protein  42.65 
 
 
230 aa  41.6  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.087898  normal  0.169456 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  27.21 
 
 
211 aa  41.6  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>