80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3460 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5131  beta-lactamase domain-containing protein  60.18 
 
 		 218 aa  265  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10801  hypothetical protein  59.45 
 
 		 212 aa  261  6e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1622  beta-lactamase domain-containing protein  58.64 
 
 		 216 aa  257  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4938  beta-lactamase domain-containing protein  57.14 
 
 		 217 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4643  beta-lactamase domain-containing protein  57.14 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4555  beta-lactamase-like protein  57.14 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3615  beta-lactamase domain protein  54.59 
 
 		 215 aa  235  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  47.66 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6881  beta-lactamase domain protein  48.4 
 
 		 207 aa  191  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  46.77 
 
 		 216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5062  beta-lactamase domain protein  46.32 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  39.67 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0779  beta-lactamase domain-containing protein  42.45 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0834  beta-lactamase domain-containing protein  40.57 
 
 		 209 aa  146  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.572776  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4981  beta-lactamase domain-containing protein  41.79 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220064 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35790  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  40.3 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  38.6 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0058  hypothetical protein  37.26 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8107  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.48 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2841  beta-lactamase domain-containing protein  35.45 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  36.45 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  35.35 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3973  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.72 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1742  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.4 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611049  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2372  hypothetical protein  35.23 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000518182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  36.13 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1881  Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  36.79 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2637  hypothetical protein  36 
 
 		 190 aa  89.4  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.48007  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  27.63 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  26.09 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  26.99 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  41.46 
 
 		 667 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  25 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  26.46 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  24.55 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  36.25 
 
 		 365 aa  49.3  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  27.35 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1362  metal-dependent hydrolase  30.77 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2464  outer membrane protein  33.78 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1933  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  25.67 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  33.78 
 
 		 320 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  33.78 
 
 		 320 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2750  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.435711  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 352 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 		 367 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  33.78 
 
 		 320 aa  45.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2914  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  25.67 
 
 		 255 aa  45.1  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0666  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  32.43 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  27.27 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1476  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259193 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0805  hypothetical protein  26.98 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  35.29 
 
 		 403 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  32.43 
 
 		 320 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3422  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 535 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195853  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0721  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.42 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  25.87 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1715  metal-dependent hydrolase  29.05 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207116 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  37.31 
 
 		 351 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4213  beta-lactamase domain protein  37.68 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2419  hypothetical protein  24.08 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000960503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  33.78 
 
 		 320 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  34.78 
 
 		 360 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5192  hypothetical protein  27.08 
 
 		 541 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6475  beta-lactamase domain-containing protein  33.9 
 
 		 538 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  36.23 
 
 		 409 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  31.08 
 
 		 320 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1725  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12233  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  37.31 
 
 		 351 aa  42.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  37.33 
 
 		 388 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1519  metal-dependent hydrolase  30.87 
 
 		 234 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.835845 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0741  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.08 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.33 
 
 		 385 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0050  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.88 
 
 		 210 aa  42  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000302941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  33.77 
 
 		 371 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0717  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.08 
 
 		 208 aa  41.6  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  29.73 
 
 		 348 aa  41.6  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16670  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  28.5 
 
 		 228 aa  41.6  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.242022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>